RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 TLK2Q86UE8 772 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 IL27Q8NEV9 243 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 WASF1Q92558 559 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 ANO3Q9BYT9 981 aa22.67■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 KBTBD13C9JR72 458 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 FOSBP53539 338 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 AP3B2Q13367 1082 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 TTLL4Q14679 1199 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC41Q15345 812 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 RNF180Q86T96 592 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 TEX2Q8IWB9 1127 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 BICD2Q8TD16 824 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 ALG1Q9BT22 464 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 SPC25Q9HBM1 224 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.66■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 MYADML2A6NDP7 307 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 DNM1LO00429 736 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 ADAMTS4O75173 837 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 ARIH2O95376 493 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 FOSP01100 380 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 XBP1P17861 261 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 MCM2P49736 904 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.65■■□□□ 1.22
HLA-B-255ENST00000498007 RGS20O76081 388 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 RGS19P49795 217 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 COPS5Q92905 334 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 TMX3Q96JJ7 454 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.64■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 STAM2O75886 525 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 GJA9P57773 515 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 LY6KQ17RY6 165 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 GNPTABQ3T906 1256 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.63■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 BEX3Q00994 111 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.62■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 SORBS3O60504 671 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 SREBF1P36956 1147 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 MCTP2Q6DN12 878 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 BLIDQ8IZY5 108 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.61■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP4P98171 946 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 TRIM29Q14134 588 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 NPY5RQ15761 445 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 GNASQ5JWF2 1037 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 GALNT17Q6IS24 598 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 NLRX1Q86UT6 975 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 FERMT2Q96AC1 680 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 Q9Y3F1 56 aa22.6■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 CTAGE5O15320 804 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 FIBPO43427 364 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 GH1P01241 217 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 COL6A1P12109 1028 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 KCNA10Q16322 511 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.59■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 ITGB5P18084 799 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF76P36508 570 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 CPT1AP50416 773 aa22.58■■□□□ 1.21
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP1Q07960 439 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.7 ms