RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496253.1

MFSD9-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 9, human

TSL 2

Gene MFSD9, Length 347 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD9-208	ENST00000496253	CCND2	P30279	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CDK7	P50613	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ANTXR2	P58335	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GRM4	Q14833	912 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SEC23A	Q15436	765 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PTGIS	Q16647	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RETREG2	Q8NC44	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PBX4	Q9BYU1	374 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF576	Q9H609	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MSRA	Q9UJ68	235 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	OPLAH	O14841	1288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC27A2	O14975	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DDAH1	O94760	285 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GGPS1	O95749	300 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	NR3C2	P08235	984 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CTSH	P09668	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ACTN1	P12814	892 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MYOG	P15173	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	EDNRB	P24530	442 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KIF5B	P33176	963 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KCNJ6	P48051	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PSEN2	P49810	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FGD1	P98174	961 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MFSD10	Q14728	455 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	PGM5	Q15124	567 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RAB30	Q15771	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	DGKD	Q16760	1214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	CUL5	Q93034	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SPATA33	Q96N06	139 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	LY9	Q9HBG7	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253		Q9Y3F1	56 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MFSD9-208	ENST00000496253	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253		A6NJR5	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	CYTH3	O43739	400 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	KPNA6	O60684	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	CDC45	O75419	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	CSPG5	O95196	566 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	CA3	P07451	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	MARK3	P27448	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	MCM5	P33992	734 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	NT5C2	P49902	561 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	HSD17B4	P51659	736 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MFSD9-208	ENST00000496253	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64

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