RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 PDCD2LQ9BRP1 358 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 MYL10Q9BUA6 226 aa21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 GH1P01241 217 aa21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 LY9Q9HBG7 655 aa21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 SCN5AQ14524 2016 aa21.43■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ERICH2A1L162 156 aa21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 DLL1O00548 723 aa21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 FGBP02675 491 aa21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF576Q9H609 170 aa21.42■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 GBF1Q92538 1859 aa21.41■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.41■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 KPNA6O60684 536 aa21.41■■□□□ 1.02
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CHD1L-209ENST00000492728 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.41■■□□□ 1.02
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CHD1L-209ENST00000492728 CHMP4BP1P59074 171 aa21.41■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 PGM5Q15124 567 aa21.41■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
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CHD1L-209ENST00000492728 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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CHD1L-209ENST00000492728 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.4■■□□□ 1.02
CHD1L-209ENST00000492728 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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CHD1L-209ENST00000492728 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.39■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SLC27A2O14975 620 aa21.39■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 PRC1O43663 620 aa21.39■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF286BP0CG31 522 aa21.39■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SP2Q02086 613 aa21.39■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.39■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.38■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.38■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.38■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 NECTIN1Q15223 517 aa21.37■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.37■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SESTD1Q86VW0 696 aa21.37■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.37■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 PITPNM1O00562 1244 aa21.36■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 IQCF3P0C7M6 154 aa21.36■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 GPNMBQ14956 572 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 PTGISQ16647 500 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 DGKDQ16760 1214 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.36■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 LRRC2Q9BYS8 371 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 HDAC6Q9UBN7 1215 aa21.36■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 ZBBXA8MT70 800 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 HAS3O00219 553 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 GGPS1O95749 300 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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CHD1L-209ENST00000492728 CASC1Q6TDU7 716 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 WNT8BQ93098 351 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 MAP3K14Q99558 947 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 ALG1Q9BT22 464 aa21.35■■□□□ 1.01
CHD1L-209ENST00000492728 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.35■■□□□ 1.01
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