RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 H3BNC9 293 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 PLA2G6O60733 806 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ICAM1P05362 532 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ATP5JP18859 108 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TDO2P48775 406 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 RBL2Q08999 1139 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TCF15Q12870 199 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 AAMPQ13685 434 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ANKRD45Q5TZF3 282 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 RPAINQ86UA6 219 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 SESTD1Q86VW0 696 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.56■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM221A6NGB7 291 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 M0R296 226 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 NCK2O43639 380 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 CALML3P27482 149 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 COL19A1Q14993 1142 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 RCSD1Q6JBY9 416 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 LNPKQ9C0E8 428 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.55■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 NFIBO00712 420 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 LGR5O75473 907 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 SLC30A10Q6XR72 485 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM67Q6ZTA4 783 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 YME1L1Q96TA2 773 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 MTMR7Q9Y216 660 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TRIOO75962 3097 aa18.54■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 STXBP3O00186 592 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 MBTPS2O43462 519 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TECTAO75443 2155 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 APPP05067 770 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TFAP4Q01664 338 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 FBXO11Q86XK2 927 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM192Q8IY95 271 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 C7orf31Q8N865 590 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 PI4K2BQ8TCG2 481 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 AFG1LQ8WV93 481 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 STX8Q9UNK0 236 aa18.53■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 CACNA1AO00555 2505 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 MMP3P08254 477 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 LTBRP36941 435 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 PTK7Q13308 1070 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 CCDC96Q2M329 555 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SRPRB-204ENST00000484684 C5orf42Q9H799 3197 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 B4DLN1 442 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ARIH2O95376 493 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RNF207Q6ZRF8 634 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RASGRP2Q7LDG7 609 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CHST3Q7LGC8 479 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SKAP1Q86WV1 359 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 FBXL6Q8N531 539 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DBF4BQ8NFT6 615 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 KAT2BQ92831 832 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.51■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 EMSYQ7Z589 1322 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 UPP2O95045 317 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MX1P20591 662 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 EDNRBP24530 442 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 PDE4AP27815 886 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 NUCB1Q02818 461 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MBTPS1Q14703 1052 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ALG1Q9BT22 464 aa18.5■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 GH1P01241 217 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 GNAT2P19087 354 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SLC16A2P36021 539 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CTC1Q2NKJ3 1217 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TRAF7Q6Q0C0 670 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DNERQ8NFT8 737 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CD207Q9UJ71 328 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.49■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 GPAA1O43292 621 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CTNNB1P35222 781 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 PSEN2P49810 448 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RPS6P62753 249 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HYAL1Q12794 435 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DGKDQ16760 1214 aa18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms