RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484134.5

RPUSD3-216, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,491 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-216ENST00000484134 PALMO75781 387 aa21.83■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CD248Q9HCU0 757 aa21.83■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ITGB4P16144 1822 aa21.82■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 TECP42680 631 aa21.82■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 OR52Z1P0C646 297 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 EVA1CP58658 441 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 KCNMA1Q12791 1236 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 IFT88Q13099 833 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.82■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 PNMA1Q8ND90 353 aa21.82■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.81■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 MYMKA6NI61 221 aa21.81■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 C6orf89Q6UWU4 347 aa21.8■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 BARHL2Q9NY43 387 aa21.8■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 RNF14Q9UBS8 474 aa21.8■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa21.8■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 KLRC1P26715 233 aa21.8■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 CEP85LQ5SZL2 805 aa21.8■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 E7EVH7 732 aa21.79■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 MYBP10242 640 aa21.77■■□□□ 1.08
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RPUSD3-216ENST00000484134 ECHS1P30084 290 aa21.77■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 SMTNP53814 917 aa21.77■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ERVK-9P63128 1117 aa21.77■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.77■■□□□ 1.08
RPUSD3-216ENST00000484134 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.77■■□□□ 1.08
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