RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 MYO1EQ12965 1108 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FMNL3Q8IVF7 1028 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 NARFQ9UHQ1 456 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 TEX11Q8IYF3 940 aa17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ENO4A6NNW6 628 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 NYXQ9GZU5 481 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.89■□□□□ 0.46
CCSAP-204ENST00000483092 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NHSL1Q5SYE7 1610 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FNTAP49354 379 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PTGISQ16647 500 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 INF2Q27J81 1249 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ALS2CLQ60I27 953 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SH3GL2Q99962 352 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MAGEA1P43355 309 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NT5DC1Q5TFE4 455 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TMC4Q7Z404 712 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM58Q8NG06 486 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SPDL1Q96EA4 605 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 OSBPL9Q96SU4 736 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC113Q9H0I3 377 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SNX12Q9UMY4 172 aa17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FSBPO95073 299 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 KIF4AO95239 1232 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 EMBQ6PCB8 327 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 VCPKMTQ9H867 229 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TLDC2A0PJX2 215 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SMTNP53814 917 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF7Q02833 373 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PICALMQ13492 652 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TAX1BP1Q86VP1 789 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM205AQ6ZU69 1335 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RIMBP2O15034 1052 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RPS6KA4O75676 772 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 FTCDO95954 541 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CALM1P0DP23 149 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CALM2P0DP24 149 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CALM3P0DP25 149 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IFFO1Q0D2I5 559 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PAK2Q13177 524 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRADDQ15628 312 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD2Q9GZV1 360 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MCM8Q9UJA3 840 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PLAAQ9Y263 795 aa17.88■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RPN1P04843 607 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 HYOU1Q9Y4L1 999 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MYH13Q9UKX3 1938 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PSMA7O14818 248 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 MYZAPP0CAP1 466 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CNBD1Q8NA66 436 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM31Q9BZY9 425 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 UFL1O94874 794 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 GLI1P08151 1106 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 NPY5RQ15761 445 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 WDR59Q6PJI9 974 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RWDD2AQ9UIY3 292 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 C6orf229H3BNL8 230 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 IL17AQ16552 155 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CREG2Q8IUH2 290 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 RRAGAQ7L523 313 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-204ENST00000483092 UBA5Q9GZZ9 404 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms