RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PTH1RQ03431 593 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 DGKDQ16760 1214 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 HOMER1Q86YM7 354 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 KAT2BQ92831 832 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 HSD17B4P51659 736 aa22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 MTMR8Q96EF0 704 aa22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ALG1Q9BT22 464 aa22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa22.38■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 LAMA4Q16363 1823 aa22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SORBS3O60504 671 aa22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CYP21A2P08686 494 aa22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.37■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ERICH2A1L162 156 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CA3P07451 260 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CHMLP26374 656 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PSEN2P49810 448 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 LAMC2Q13753 1193 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SESTD1Q86VW0 696 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 C7orf31Q8N865 590 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CAGE1Q8TC20 777 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PIGSQ96S52 555 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SLC9A7Q96T83 725 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CERS4Q9HA82 394 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SENP2Q9HC62 589 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.36■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 GRM4Q14833 912 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 THEGQ9P2T0 379 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.35■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 RFXAPO00287 272 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 RGS20O76081 388 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 POLR2MP0CAP2 368 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF286BP0CG31 522 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 GHRHRQ02643 423 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 MFSD10Q14728 455 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 WTAPQ15007 396 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PGM5Q15124 567 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PPTC7Q8NI37 304 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.34■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 KIF28PB7ZC32 967 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 E7EWF7 191 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SELPP16109 830 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 TRAF1Q13077 416 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 NCOA7Q8NI08 942 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 IL31RAQ8NI17 732 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 SPATA33Q96N06 139 aa22.33■■□□□ 1.17
SHQ1-206ENST00000471526 CYTH3O43739 400 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 GGPS1O95749 300 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 KCNJ6P48051 423 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 GPNMBQ14956 572 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ASB2Q96Q27 587 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 VCANP13611 3396 aa22.32■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 HAS3O00219 553 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 PPFIA4O75335 1185 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 BAIAP3O94812 1187 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 F2P00734 622 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CKBP12277 381 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 CCND2P30279 289 aa22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SHQ1-206ENST00000471526 SP2Q02086 613 aa22.31■■□□□ 1.16
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