RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-206ENST00000469757 LTBP2Q14767 1821 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3-206ENST00000469757 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 MYADML2A6NDP7 307 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 KBTBD13C9JR72 458 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARIH2O95376 493 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGK1P00558 417 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOSP01100 380 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SREBF1P36956 1147 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-206ENST00000469757 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf49Q9H6J7 331 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 PDGFCQ9NRA1 345 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC3-206ENST00000469757 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC3-206ENST00000469757 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.48□□□□□ -0.89
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