RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYL3P08590 195 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 RCAN1P53805 252 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGAP1Q07960 439 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR153Q6NV75 609 aa21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZBTB43O43298 467 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCND2P30279 289 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMC6P62333 389 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 FPGSQ05932 587 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 LY6KQ17RY6 165 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL31RAQ8NI17 732 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 CUL5Q93034 780 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRCH3Q96II8 777 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 RTN1Q16799 776 aa21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 STAM2O75886 525 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 RGS20O76081 388 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MMP3P08254 477 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD5Q6N075 450 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 AFG1LQ8WV93 481 aa21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 B4GALT4O60513 344 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGD1P98174 961 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 SHHQ15465 462 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 TANC1Q9C0D5 1861 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 NID2Q14112 1375 aa21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 MEIS2O14770 477 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 TGFB3P10600 412 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 LAMC2Q13753 1193 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 GNPTABQ3T906 1256 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXL16Q8N461 479 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPTC7Q8NI37 304 aa21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC10-208ENST00000469521 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CPA1P15085 419 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPS6KB1P23443 525 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMA5P28066 241 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 EPHB4P54760 987 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 FUT2Q10981 343 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 Q6ZUG5 572 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM199Q8N511 208 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 HIPK3Q9H422 1215 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 DOCK5Q9H7D0 1870 aa21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 ICAM3P32942 547 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRF1Q92994 677 aa21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 GGPS1O95749 300 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 APOBRQ0VD83 1088 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 SESTD1Q86VW0 696 aa21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC10-208ENST00000469521 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.67■■□□□ 1.06
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