RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2B6P20813 491 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CTGFP29279 349 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 NASPP49321 788 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 PRMT2P55345 433 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SETQ01105 290 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 STK38Q15208 465 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 Q4G0T1 1027 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 OLFML2BQ68BL8 750 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CLEC17AQ6ZS10 378 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CD99L2Q8TCZ2 262 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MAML3Q96JK9 1138 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CDHR1Q96JP9 859 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 FGD4Q96M96 766 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MBOAT7Q96N66 472 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 USP28Q96RU2 1077 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MXRA8Q9BRK3 442 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 JADE2Q9NQC1 790 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 ASTN1O14525 1302 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MEIS1O00470 390 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TBX3O15119 743 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 EDIL3O43854 480 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MARCH6O60337 910 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 BAG4O95429 457 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TDP2O95551 362 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 FLT3LGP49771 235 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 IRF5Q13568 498 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 NBR1Q14596 966 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC39A14Q15043 492 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CALCRLQ16602 461 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR16Q569H4 304 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNV1Q6PIU1 500 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 ARMCX2Q7L311 632 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 PLA2G4DQ86XP0 818 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00301Q8NCQ3 95 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 IL31RAQ8NI17 732 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 NPLOC4Q8TAT6 608 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 GPRASP2Q96D09 838 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA32Q96LK8 384 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TINF2Q9BSI4 451 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SRRDQ9UH36 339 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 TSKSQ9UJT2 592 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 RCOR1Q9UKL0 485 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 CLIC4Q9Y696 253 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF236Q9UL36 1845 aa10.65□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PLXNB2O15031 1838 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM86B1E9PN63 330 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA6L22H0YM25 854 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 SPTLC2O15270 562 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FIBPO43427 364 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM86B2P0C5J1 330 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 OR52Z1P0C646 297 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGB5P18084 799 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPHP41219 470 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PRKCZQ05513 592 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PTGDRQ13258 359 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 MTMR1Q13613 665 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPAQ15257 358 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 SLFN12Q8IYM2 578 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM20AQ96MK3 541 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 VTA1Q9NP79 307 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRQQ9UN88 632 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 CNPY2Q9Y2B0 182 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT7AO00755 349 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC37A4O43826 429 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP6R2O75170 966 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 TGFB3P10600 412 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ICAM3P32942 547 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 DTHD1Q6ZMT9 781 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 C4orf32Q8N8J7 132 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 CYP2W1Q8TAV3 490 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 RAET1EQ8TD07 263 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 FERMT2Q96AC1 680 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 LENG9Q96B70 501 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 MTMR9Q96QG7 549 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF577Q9BSK1 485 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms