RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 OTOFQ9HC10 1997 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CLRN2A0PK11 232 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP27XA6NNY8 438 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L15C9J2P7 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L11C9JVI0 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L18D6R9N7 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L22D6RA61 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L19D6RCP7 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L20D6RJB6 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TBX3O15119 743 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CBFA2T2O43439 604 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 TXLNAP40222 546 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PRCPP42785 496 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ECE1P42892 770 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PSEN2P49810 448 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 UBASH3AP57075 661 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 USP17L24Q0WX57 530 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CALCRLQ16602 461 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ECM1Q16610 540 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 Q4G0T1 1027 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNT9Q6UX72 402 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TMC6Q7Z403 805 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NIM1KQ8IY84 436 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TC2NQ8N9U0 490 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.36□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GINM1Q9NU53 330 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RMND1Q9NWS8 449 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 GDAQ9Y2T3 454 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF536O15090 1300 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 HRO43593 1189 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZBTB7AO95365 584 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SKILP12757 684 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 UBA7P41226 1012 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TNNI2P48788 182 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP4P98171 946 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KRT31Q15323 416 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZCWPW2Q504Y3 356 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO11Q86XK2 927 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 VAV3Q9UKW4 847 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FAM86B1E9PN63 330 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FANCGO15287 622 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TEX33O43247 280 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 FAM86B2P0C5J1 330 aa6.34□□□□□ -1.39
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