RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460041.5

HOXB-AS3-202, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 728 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RMDN3Q96TC7 470 aa12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KAT14Q9H8E8 782 aa12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COG5Q9UP83 839 aa12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MICAL3Q7RTP6 2002 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HIP1O00291 1037 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KDM4AO75164 1064 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CXCL10P02778 98 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SELPP16109 830 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL9A1P20849 921 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GPNMBQ14956 572 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DGKDQ16760 1214 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LY6KQ17RY6 165 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 FBXO11Q86XK2 927 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SAMD3Q8N6K7 520 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DSCC1Q9BVC3 393 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KATNAL1Q9BW62 490 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CPVLQ9H3G5 476 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LMCD1Q9NZU5 365 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ZSWIM5Q9P217 1185 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 COL20A1Q9P218 1284 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KAT6AQ92794 2004 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 B4E1Z4 1266 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HAS3O00219 553 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 F2P00734 622 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNJ6P48051 423 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HSD17B4P51659 736 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 WDR5P61964 334 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LAMC2Q13753 1193 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LRRC8DQ7L1W4 858 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHD1LQ86WJ1 897 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPTC7Q8NI37 304 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KRT23Q9C075 422 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 JMJD4Q9H9V9 463 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PXMP2Q9NR77 195 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EPOPA6NHQ4 379 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RFXAPO00287 272 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TLL1O43897 1013 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EFCAB14O75071 495 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPFIA4O75335 1185 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGEF15O94989 841 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NR3C2P08235 984 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CKBP12277 381 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NUCB1Q02818 461 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PTK7Q13308 1070 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARHGEF16Q5VV41 709 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 STOX1Q6ZVD7 989 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 ARNTL2Q8WYA1 636 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MTMR8Q96EF0 704 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 AMNQ9BXJ7 453 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 OPLAHO14841 1288 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 LPXNO60711 386 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TGFB3P10600 412 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PSEN2P49810 448 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TFF2Q03403 129 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 TRAF1Q13077 416 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GRB10Q13322 594 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 C7orf31Q8N865 590 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CERS4Q9HA82 394 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MRVI1Q9Y6F6 885 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DOCK5Q9H7D0 1870 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 NBNO60934 754 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 RGS20O76081 388 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 GJB5O95377 273 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CFBP00751 764 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 KCNQ1P51787 676 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 CHMP4BP1P59074 171 aa11.95□□□□□ -0.5
HOXB-AS3-202ENST00000460041 MFSD10Q14728 455 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms