RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 RASIP1Q5U651 963 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 C7orf31Q8N865 590 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PIGSQ96S52 555 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CERS4Q9HA82 394 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TET1Q8NFU7 2136 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF28PB7ZC32 967 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB5O15062 677 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MMP3P08254 477 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 IQCF3P0C7M6 154 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CHMLP26374 656 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 DGKDQ16760 1214 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 USP38Q8NB14 1042 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 IL27Q8NEV9 243 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 NCOA7Q8NI08 942 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 IL25Q9H293 177 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PXMP2Q9NR77 195 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 VCANP13611 3396 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 E7EWF7 191 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PFKMP08237 780 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP21A2P08686 494 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR2MP0CAP2 368 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF286BP0CG31 522 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CCND2P30279 289 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RFC2P35250 354 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNJ6P48051 423 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PSEN2P49810 448 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGAP1Q07960 439 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TRAF1Q13077 416 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 LAMC2Q13753 1193 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SEC23AQ15436 765 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 HDAC6Q9UBN7 1215 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RFXAPO00287 272 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GGPS1O95749 300 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MFSD10Q14728 455 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GRM4Q14833 912 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CASC1Q6TDU7 716 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SPATA33Q96N06 139 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MAF1Q9H063 256 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SENP2Q9HC62 589 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PITPNM1O00562 1244 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TLL1O43897 1013 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CA3P07451 260 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SELPP16109 830 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 HSD17B4P51659 736 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ADGRE1Q14246 886 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PGM5Q15124 567 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM117BQ6P1L5 589 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KAT2BQ92831 832 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CUL5Q93034 780 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PDCD2LQ9BRP1 358 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MYL10Q9BUA6 226 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 KATNAL1Q9BW62 490 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 RTEL1Q9NZ71 1219 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPRSQ13332 1948 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC69A6NI79 296 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 OPLAHO14841 1288 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 PPFIA4O75335 1185 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 SP4Q02446 784 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 GNPTABQ3T906 1256 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP1-204ENST00000459646 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms