RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGS20O76081 388 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD4P01730 458 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGAP1Q07960 439 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VSIG10LQ86VR7 867 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRVI1Q9Y6F6 885 aa17.97■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB43O43298 467 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIMP1P01033 207 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GH1P01241 217 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCND2P30279 289 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf50Q5SZB4 431 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FRMPD4Q14CM0 1322 aa17.96■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMP3P08254 477 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPHB4P54760 987 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FGD1P98174 961 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FPGSQ05932 587 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SHHQ15465 462 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RTN1Q16799 776 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP17L6PQ6QN14 398 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AFG1LQ8WV93 481 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CUL5Q93034 780 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRPV6Q9H1D0 765 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.95■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PIK3CDO00329 1044 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MEIS2O14770 477 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B4GALT4O60513 344 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KPNA6O60684 536 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZUG5 572 aa17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RCAN1P53805 252 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOBRQ0VD83 1088 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FUT2Q10981 343 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NBPF20Q3BBV1 942 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MFSD5Q6N075 450 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNV1Q6PIU1 500 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSTPIP2Q9H939 334 aa17.93■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SORBS3O60504 671 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CASTP20810 708 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS6KB1P23443 525 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC27P30260 824 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2C18P33260 490 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAMC2Q13753 1193 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BRF1Q92994 677 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIPK3Q9H422 1215 aa17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STAM2O75886 525 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GGPS1O95749 300 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMA5P28066 241 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHMP4BP1P59074 171 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SP2Q02086 613 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DGKDQ16760 1214 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2SQ16763 222 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM47CQ5HY64 1035 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WWC2Q6AWC2 1192 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPTC7Q8NI37 304 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP26Q9BXU7 913 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UMODL1Q5DID0 1318 aa17.91■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TGFB3P10600 412 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CSF2RAP15509 400 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADD1P35611 737 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNPTABQ3T906 1256 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCNX4Q63HM2 1172 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR153Q6NV75 609 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFRKBQ6P4R8 1299 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL16Q8N461 479 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM199Q8N511 208 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KAT2BQ92831 832 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA33Q96N06 139 aa17.9■□□□□ 0.46
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms