RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM58Q8NG06 486 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PHKBQ93100 1093 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM167BQ9BTA0 163 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC26A0AVF1 554 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GNPTABQ3T906 1256 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SPACA7Q96KW9 195 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DSCC1Q9BVC3 393 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ERICH2A1L162 156 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAPO00193 183 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TM4SF1P30408 202 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CRKLP46109 303 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 COPB1P53618 953 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP27A1Q02318 531 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 UBXN1Q04323 297 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP4R3AQ6IN85 833 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX12Q9UMY4 172 aa9.26□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ANO9A1A5B4 782 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LINGO3P0C6S8 592 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NEFHP12036 1026 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TFCP2Q12800 502 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DPYDQ12882 1025 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNI3KQ59H18 835 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM182BQ5T319 152 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EMC10Q5UCC4 262 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP11Q8TF27 550 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CCT6BQ92526 530 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS6KC1Q96S38 1066 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RTL9Q8NET4 1388 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC3O43617 180 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT83P78385 493 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM14Q14142 442 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NFXL1Q6ZNB6 911 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC63Q8NA47 563 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 AHCYL1O43865 530 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FESP07332 822 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GLI1P08151 1106 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMB3Q13751 1172 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR59Q6PJI9 974 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM74Q86UV6 250 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM73Q86UV7 250 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 STAMQ92783 540 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAAQ9Y263 795 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 LTBP1Q14766 1721 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLGA6L10A6NI86 522 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF26B4DH59 902 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GNAT1P11488 350 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM29Q14134 588 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 NBPF15Q8N660 670 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2W6PQ8NHA6 318 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 HAUS7Q99871 368 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 PANK4Q9NVE7 773 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms