RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 TCP1P17987 556 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PRDX5P30044 214 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SKOR1P84550 965 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SETQ01105 290 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 UBE4AQ14139 1066 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TXNRD1Q16881 649 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DNAAF5Q86Y56 855 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SEMA6BQ9H3T3 888 aa17.07■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TSPY2A6NKD2 308 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NR1D1P20393 614 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CEP85LQ5SZL2 805 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF662Q6ZS27 426 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CABP7Q86V35 215 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CALM1P0DP23 149 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CALM2P0DP24 149 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CALM3P0DP25 149 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 KCNB1Q14721 858 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC41Q15345 812 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CCT8L2Q96SF2 557 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 KBTBD4Q9NVX7 518 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PLAGL2Q9UPG8 496 aa17.06■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RPS6KA4O75676 772 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TECP42680 631 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TRAPPC10P48553 1259 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 LETM2Q2VYF4 491 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 EP400NLQ6ZTU2 488 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 IFT20Q8IY31 132 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RETREG2Q8NC44 543 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PIK3R5Q8WYR1 880 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NDST4Q9H3R1 872 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF804BA4D1E1 1349 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 GOLGA8HP0CJ92 632 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 RFC4P35249 363 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 EHHADHQ08426 723 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MTA3Q9BTC8 594 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM9Q9C026 710 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 EPN3Q9H201 632 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 GOLPH3Q9H4A6 298 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.05■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PALMO75781 387 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 EPB41P11171 864 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 USP8P40818 1118 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MECOMQ03112 1051 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NLRP14Q86W24 1093 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA0895Q8NCT3 520 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DDAH1O94760 285 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PTGISQ16647 500 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CFAP221Q4G0U5 840 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 VWA3BQ502W6 1294 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 IQCKQ8N0W5 287 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 GLIS3Q8NEA6 775 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 UIMC1Q96RL1 719 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ANAPC4Q9UJX5 808 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHA6Q9UN73 950 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHA4Q9UN74 947 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PLAAQ9Y263 795 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ARAP2Q8WZ64 1704 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TMOD1P28289 359 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 GSCP56915 257 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CAVIN3Q969G5 261 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FAM212AQ96EL1 285 aa17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP17.04■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 BICDL2A1A5D9 508 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 PPP1R37O75864 691 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FAM196AQ6ZSG2 479 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 FAM114A1Q8IWE2 563 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NOX5Q96PH1 765 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 ERGIC2Q96RQ1 377 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CEP57Q86XR8 500 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 NYXQ9GZU5 481 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SIK3Q9Y2K2 1263 aa17.03■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 DOCK2Q92608 1830 aa17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 SPRED3Q2MJR0 410 aa17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 KDM7AQ6ZMT4 941 aa17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC13Q8IYE1 715 aa17.02■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 PACSIN1Q9BY11 444 aa17.02■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CALML3P27482 149 aa17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms