RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 OTOP2Q7RTS6 562 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 KAT2BQ92831 832 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF576Q9H609 170 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 SCN5AQ14524 2016 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 TANC1Q9C0D5 1861 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 IL31RAQ8NI17 732 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 FOSL2P15408 326 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 CTAGE1Q96RT6 745 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 LY9Q9HBG7 655 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-250ENST00000434333 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PGM5Q15124 567 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 VSIG10LQ86VR7 867 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SESTD1Q86VW0 696 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PITPNM1O00562 1244 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CATIPQ7Z7H3 387 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MYL10Q9BUA6 226 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PFKMP08237 780 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 POLR2MP0CAP2 368 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CASTP20810 708 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 TRAF1Q13077 416 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SKAP1Q86WV1 359 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MAP3K14Q99558 947 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MTA3Q9BTC8 594 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SLC27A2O14975 620 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PRC1O43663 620 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 DDAH1O94760 285 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 IQCF3P0C7M6 154 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 LAMC2Q13753 1193 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 NECTIN1Q15223 517 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 RAB30Q15771 203 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 DGKDQ16760 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PPTC7Q8NI37 304 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 VCANP13611 3396 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 HAS3O00219 553 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 F2P00734 622 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CHMP4BP1P59074 171 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 SP2Q02086 613 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PTGISQ16647 500 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PIBF1Q8WXW3 757 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 TET1Q8NFU7 2136 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 RFC2P35250 354 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 BFSP2Q13515 415 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 CASC1Q6TDU7 716 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.27■■□□□ 1.32
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HLA-B-250ENST00000434333 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-250ENST00000434333 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF286BP0CG31 522 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SMARCA1P28370 1054 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CCND2P30279 289 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MCM5P33992 734 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 PSEN2P49810 448 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 RABGGTBP53611 331 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 KCNV1Q6PIU1 500 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 USP38Q8NB14 1042 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM87BQ96K49 555 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 HDAC6Q9UBN7 1215 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 NOD1Q9Y239 953 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 ZBBXA8MT70 800 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 SORBS3O60504 671 aa23.25■■□□□ 1.31
HLA-B-250ENST00000434333 GGPS1O95749 300 aa23.25■■□□□ 1.31
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