RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429923.5

LSP1-208, Transcript of lymphocyte specific protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene LSP1, Length 582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1-208ENST00000429923 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 DUSP28Q4G0W2 176 aa22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 TMX3Q96JJ7 454 aa22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 ALG1Q9BT22 464 aa22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.9■■□□□ 1.26
LSP1-208ENST00000429923 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ADCY6O43306 1168 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 JAK2O60674 1132 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SMPD1P17405 629 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 NKX3-2P78367 333 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TTLL4Q14679 1199 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ANO3Q9BYT9 981 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.89■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 GJA9P57773 515 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TMEM260Q9NX78 707 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.88■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 DNM1LO00429 736 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 DTNBO60941 627 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ADAMTS4O75173 837 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 RGS20O76081 388 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TGFB3P10600 412 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 LRRC41Q15345 812 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CCDC62Q6P9F0 684 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 RNF180Q86T96 592 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 BLIDQ8IZY5 108 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SPC25Q9HBM1 224 aa22.87■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 M0R2N6 131 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ADAMTS3O15072 1205 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 PGK1P00558 417 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TXNP10599 105 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ICAM3P32942 547 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SREBF1P36956 1147 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 NPY5RQ15761 445 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 GNPTABQ3T906 1256 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TLK2Q86UE8 772 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ARIH2O95376 493 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TMEM63BQ5T3F8 832 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 PGBD1Q96JS3 809 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.85■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 BRCA2P51587 3418 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 KBTBD13C9JR72 458 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 NLRX1Q86UT6 975 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.84■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CTAGE5O15320 804 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 MAFGO15525 162 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 FIBPO43427 364 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CYP3A4P08684 503 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 ARHGAP4P98171 946 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 TRIM29Q14134 588 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 LY6KQ17RY6 165 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 SNX21Q969T3 373 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 GPRASP2Q96D09 838 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.83■■□□□ 1.25
LSP1-208ENST00000429923 COL6A1P12109 1028 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 CUL4AQ13619 759 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 CDHR1Q96JP9 859 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 JADE2Q9NQC1 790 aa22.82■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.81■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 GH1P01241 217 aa22.81■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 ITGB5P18084 799 aa22.81■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 KRT40Q6A162 431 aa22.81■■□□□ 1.24
LSP1-208ENST00000429923 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.5 ms