RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.15□□□□□ -0.62
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHMP5Q9NZZ3 219 aa11.15□□□□□ -0.62
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.15□□□□□ -0.62
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.15□□□□□ -0.62
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSMA5P28066 241 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ICA1Q05084 483 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPM6BQ13491 265 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT32Q14532 448 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM83BQ5T0W9 1011 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VPS53Q5VIR6 699 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCOR2Q9Y618 2525 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0R2C6 588 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYL3P08590 195 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BFSP2Q13515 415 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NBPF20Q3BBV1 942 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SH2D4AQ9H788 454 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAH14Q0VDD8 3507 aa11.13□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BNC9 293 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FOXP2O15409 715 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC01565O15544 149 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TBX10O75333 385 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AKR1B1P15121 316 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDE6AP16499 860 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PURAQ00577 322 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HYAL1Q12794 435 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RUFY3Q7L099 469 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMX3Q96JJ7 454 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGFLR1Q9H665 355 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CD207Q9UJ71 328 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INSL6Q9Y581 213 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa11.12□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZMYM6O95789 1325 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LOC730098B7Z3J9 87 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP21A2P08686 494 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP2D6P10635 497 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALX1Q15699 326 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAPT1Q6NXT6 567 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 COL26A1Q96A83 441 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DYNLL2Q96FJ2 89 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOD1Q9Y239 953 aa11.11□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPAA1O43292 621 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCK2O43639 380 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NBNO60934 754 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CSPG5O95196 566 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPS6KB1P23443 525 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUBP1P53384 320 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 AK2P54819 239 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHMP4BP1P59074 171 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ST3GAL2Q16842 350 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 Q9Y3F1 56 aa11.1□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF292O60281 2723 aa11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHD6Q8TD26 2715 aa11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHD8Q9HCK8 2581 aa11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IKBKEQ14164 716 aa11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD1Q15327 319 aa11.09□□□□□ -0.63
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFKBIBQ15653 356 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms