RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 UTYO14607 1347 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf81C9J6K1 198 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF9O43307 516 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SCG2P13521 617 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT2Q15019 361 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CCL15Q16663 113 aa4.85□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 FYB2Q5VWT5 728 aa4.85□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 VPS52Q8N1B4 723 aa4.85□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC16A2P36021 539 aa4.84□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 SATB1Q01826 763 aa4.84□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D5Q92609 795 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V0A1Q93050 837 aa4.84□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 SYT17Q9BSW7 474 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.84□□□□□ -1.63
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ANKRD28-202ENST00000412318 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6CA6NDK9 693 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 E9PMD0 336 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 NDC80O14777 642 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SORBS3O60504 671 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 F13A1P00488 732 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2HP62256 183 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 CALCOCO2Q13137 446 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF207Q6ZRF8 634 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF4Q8WV16 495 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SELENOSQ9BQE4 189 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 DRC3Q9H069 523 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.84□□□□□ -1.63
ANKRD28-202ENST00000412318 M0R2C6 588 aa4.83□□□□□ -1.64
ANKRD28-202ENST00000412318 OPHN1O60890 802 aa4.83□□□□□ -1.64
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