RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 HAS1Q92839 578 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 DHX58Q96C10 678 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 AK8Q96MA6 479 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.15■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 LCTP09848 1927 aa23.14■■□□□ 1.3
ATG4B-204ENST00000402096 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PLA2G4DQ86XP0 818 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PXMP2Q9NR77 195 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 SLC25A27O95847 323 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PGM5Q15124 567 aa23.13■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 IL31RAQ8NI17 732 aa23.13■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 A0A087X0B3 334 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 TBX3O15119 743 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ERCC3P19447 782 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 COPB2P35606 906 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ERVK-9P63128 1117 aa23.13■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 IGSF22Q8N9C0 903 aa23.13■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 MAF1Q9H063 256 aa23.13■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 POTEMA6NI47 508 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 MSH4O15457 936 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 TOMM70O94826 608 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 Q3C1V9 767 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 WDR78Q5VTH9 848 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CABP7Q86V35 215 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN18Q99952 460 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PDCD2LQ9BRP1 358 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PDIA5Q14554 519 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 KARSQ15046 597 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 FAM20AQ96MK3 541 aa23.11■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 SLC10A3P09131 477 aa23.1■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.1■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 TSPY26PQ9H489 355 aa23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.09■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 STAT6P42226 847 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PLIN2Q99541 437 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.09■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 CCNA1P78396 465 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 KANK3Q6NY19 840 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CALML4Q96GE6 196 aa23.09■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 USP25Q9UHP3 1055 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 NR3C2P08235 984 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC192P0DO97 292 aa23.08■■□□□ 1.29
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ATG4B-204ENST00000402096 KRT79Q5XKE5 535 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 SNX29Q8TEQ0 813 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 MROH8Q9H579 483 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4B-204ENST00000402096 PLXNB2O15031 1838 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-204ENST00000402096 POTEB2H3BUK9 544 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-204ENST00000402096 SLFN14P0C7P3 912 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-204ENST00000402096 ARP10275 920 aa23.07■■□□□ 1.28
ATG4B-204ENST00000402096 ITGB5P18084 799 aa23.07■■□□□ 1.28
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