RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366170.6

VSTM1-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSTM1, Length 654 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1-202ENST00000366170 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PLXNB2O15031 1838 aa14.73□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ASB14A6NK59 587 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 WNT7AO00755 349 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SPTLC2O15270 562 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NEMFO60524 1076 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FKTNO75072 461 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 HOXD10P28358 340 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CEP55Q53EZ4 464 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PRR16Q569H4 304 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MORN1Q5T089 497 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 NLRX1Q86UT6 975 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PLA2G4DQ86XP0 818 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 IL31RAQ8NI17 732 aa14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 FRMPD4Q14CM0 1322 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MEIS1O00470 390 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 STAM2O75886 525 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SLC34A2O95436 690 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CYP2B6P20813 491 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 RGS2P41220 211 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ME1P48163 572 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PTPAQ15257 358 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CALCRLQ16602 461 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 Q4G0T1 1027 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 ERO1AQ96HE7 468 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 TRIM47Q96LD4 638 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MBOAT7Q96N66 472 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 JADE2Q9NQC1 790 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 GJD2Q9UKL4 321 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.71□□□□□ -0.05
VSTM1-202ENST00000366170 MGAMO43451 1857 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FAM86B1E9PN63 330 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 LAD1O00515 517 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PPP6R2O75170 966 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 OR52Z1P0C646 297 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CTGFP29279 349 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TXKP42681 527 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GNPTABQ3T906 1256 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 WBP1LQ9NX94 342 aa14.7□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MAFGO15525 162 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SLC37A4O43826 429 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ARP10275 920 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ITGB5P18084 799 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 EDNRBP24530 442 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MCM4P33991 863 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 POTEDQ86YR6 584 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 USP6NLQ92738 828 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MAML3Q96JK9 1138 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FGD4Q96M96 766 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 FAM20AQ96MK3 541 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 UIMC1Q96RL1 719 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TSKSQ9UJT2 592 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ASTN1O14525 1302 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 TBX3O15119 743 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 CUTAO60888 179 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 GNRH1P01148 92 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 HOXC6P09630 235 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 PRPHP41219 470 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MTMR1Q13613 665 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ARMCX2Q7L311 632 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 MORC4Q8TE76 937 aa14.68□□□□□ -0.06
VSTM1-202ENST00000366170 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms