RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TIMP1P01033 207 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MYL3P08590 195 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 POLR2MP0CAP2 368 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CALM1P0DP23 149 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CALM2P0DP24 149 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CALM3P0DP25 149 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RXRAP19793 462 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PSMC6P62333 389 aa8.86□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GPR153Q6NV75 609 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SEPT14Q6ZU15 432 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MICU3Q86XE3 530 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 COPS5Q92905 334 aa8.86□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 LZTS2Q9BRK4 669 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A7Q9Y666 1083 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SCN5AQ14524 2016 aa8.86□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GRIN2DO15399 1336 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 A6NJR5 290 aa8.85□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 REC8O95072 547 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 GH1P01241 217 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CD4P01730 458 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NR3C2P08235 984 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCA1P28370 1054 aa8.85□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP1Q07960 439 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 KRT32Q14532 448 aa8.85□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 LY6KQ17RY6 165 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RASEFQ8IZ41 740 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 IL31RAQ8NI17 732 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NEK1Q96PY6 1258 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TRPV6Q9H1D0 765 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 VCANP13611 3396 aa8.85□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.84□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 MMP3P08254 477 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CCND2P30279 289 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 EPHB4P54760 987 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 NBR1Q14596 966 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD5Q6N075 450 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 APOA5Q6Q788 366 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 TMTC3Q6ZXV5 915 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 Q7L0L9 218 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB123Q8N688 67 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 FANCBQ8NB91 859 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 AFG1LQ8WV93 481 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
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SGMS1-201ENST00000361543 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 HIPK3Q9H422 1215 aa8.84□□□□□ -0.99
SGMS1-201ENST00000361543 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB43O43298 467 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 RGS20O76081 388 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 CYP2C18P33260 490 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 KCNV1Q6PIU1 500 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC82Q8N4S0 544 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM199Q8N511 208 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 CUL5Q93034 780 aa8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SGMS1-201ENST00000361543 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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