RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PROM2Q8N271 834 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TSG101Q99816 390 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC53A6NM62 1247 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TDP2O95551 362 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 IL1R1P14778 569 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RHBDL3P58872 404 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 EHHADHQ08426 723 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 KRT79Q5XKE5 535 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PPP1R18Q6NYC8 613 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 DYMQ7RTS9 669 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CNBD1Q8NA66 436 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ZBTB9Q96C00 473 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.23■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 GAKO14976 1311 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 LY75O60449 1722 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 POTEMA6NI47 508 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PJA2O43164 708 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 UFL1O94874 794 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 GPSM2P81274 684 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SLC20A2Q08357 652 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RRAGAQ7L523 313 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 AMIGO3Q86WK7 504 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 BAP1Q92560 729 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ZMYND10O75800 440 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MOCS3O95396 460 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MYBL2P10244 700 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SEPT2Q15019 361 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 DDX12PQ92771 950 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 ATP2B4P23634 1241 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 RFC4P35249 363 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PPP4R3AQ6IN85 833 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 PDXDC1Q6P996 788 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
SPNS3-201ENST00000355530 SNHG28P0DPA3 235 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 SRLQ86TD4 932 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 COA7Q96BR5 231 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 DRC1Q96MC2 740 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 GGA1Q9UJY5 639 aa20.2■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MYH10P35580 1976 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 EDIL3O43854 480 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 GGCXP38435 758 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MAGEA1P43355 309 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 TNNI2P48788 182 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 TSKSQ9UJT2 592 aa20.19■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC181Q5TID7 509 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 KCNK18Q7Z418 384 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 CEP72Q9P209 647 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 MYO1CO00159 1063 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 COASYQ13057 564 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.18■□□□□ 0.82
SPNS3-201ENST00000355530 NOX5Q96PH1 765 aa20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms