RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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PTPRO-202ENST00000348962 DCAF4Q8WV16 495 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRO-202ENST00000348962 KRT71Q3SY84 523 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 P2RX5Q93086 422 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 GCNAQ96QF7 691 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.83■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 PTCH1Q13635 1447 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRO-202ENST00000348962 THAP12O43422 761 aa16.82■□□□□ 0.28
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