RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.83□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PTMSP20962 102 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GJA8P48165 433 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SHISA4Q96DD7 197 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAF1Q9H063 256 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 YY1AP1Q9H869 796 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EN2P19622 333 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AK2P54819 239 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KCNC4Q03721 635 aa8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 C22orf23Q9BZE7 217 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KATNBL1Q9H079 304 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.82□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL20A1Q9P218 1284 aa8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.82□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LCTP09848 1927 aa8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MYH6P13533 1939 aa8.81□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RGS19P49795 217 aa8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NEK4P51957 841 aa8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCT2P78371 535 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ARMCX2Q7L311 632 aa8.81□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MORC4Q8TE76 937 aa8.81□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EDNRBP24530 442 aa8.8□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
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SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MEIS2O14770 477 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UQCRHP07919 91 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IFNAR1P17181 557 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CNGA1P29973 690 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SCRN1Q12765 414 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ACVR2BQ13705 512 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ANKRD1Q15327 319 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PKN1Q16512 942 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PHKBQ93100 1093 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PIK3CDO00329 1044 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ADCY6O43306 1168 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MSCO60682 206 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PPFIA3O75145 1194 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LARGE1O95461 756 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POLR2MP0CAP2 368 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 STK3Q13188 491 aa8.79□□□□□ -1
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BECN1Q14457 450 aa8.79□□□□□ -1
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