RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 MAF1Q9H063 256 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.29□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BNC9 293 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GFRA3O60609 400 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM1O75626 825 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 RB1P06400 928 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 CKBP12277 381 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NUBP1P53384 320 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PTK7Q13308 1070 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 EPC2Q52LR7 807 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD1Q719H9 257 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF4Q8WV16 495 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 EDAQ92838 391 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 NAPBQ9H115 298 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-201ENST00000296642 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IRS1P35568 1242 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL5Q5H9L2 206 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO11Q86XK2 927 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM192Q8IY95 271 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT8Q92599 483 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf80Q9BSJ5 609 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNQ9UQP3 1299 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD9Q3L8U1 2897 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH7P12883 1935 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP3O00186 592 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 GPAA1O43292 621 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 NBNO60934 754 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP3P08254 477 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGS1P23219 599 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ERMP1Q7Z2K6 904 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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PGGT1B-201ENST00000296642 RNF135Q8IUD6 432 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 FIBCD1Q8N539 461 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 AFG1LQ8WV93 481 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 APBB2Q92870 758 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MUTYHQ9UIF7 546 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 FSD2A1L4K1 749 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM221A6NGB7 291 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.25□□□□□ -0.93
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PGGT1B-201ENST00000296642 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
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PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFV1P49821 464 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMC2Q13753 1193 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 STXBP2Q15833 593 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM63BQ5T3F8 832 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SYDE2Q5VT97 1194 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRED2Q7Z698 418 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MCF2L2Q86YR7 1114 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL6Q8N531 539 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD3Q8NAB2 608 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG1Q9BT22 464 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CD207Q9UJ71 328 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR7Q9Y216 660 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 BRWD1Q9NSI6 2320 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MBTPS2O43462 519 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAT1P11488 350 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 EDNRBP24530 442 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CTNNB1P35222 781 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 THPOP40225 353 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAP25P60880 206 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 PPARAQ07869 468 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD10Q14728 455 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 COL19A1Q14993 1142 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC30A10Q6XR72 485 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST3Q7LGC8 479 aa9.24□□□□□ -0.93
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