RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287543.4

MALSU1-201, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene MALSU1, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-201ENST00000287543 FBXL16Q8N461 479 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 SNX14Q9Y5W7 946 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ALPK3Q96L96 1907 aa21.82■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CASTP20810 708 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 FPGSQ05932 587 aa21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 LY6KQ17RY6 165 aa21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 GNPTABQ3T906 1256 aa21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 COPS5Q92905 334 aa21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PSTPIP2Q9H939 334 aa21.81■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ARHGAP1Q07960 439 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 MFSD5Q6N075 450 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 TMEM199Q8N511 208 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 BRPF3Q9ULD4 1205 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 GRIN2DO15399 1336 aa21.8■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CEP290O15078 2479 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ITGB8P26012 769 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PSMC6P62333 389 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 DGKDQ16760 1214 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 AFG1LQ8WV93 481 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 FRMPD4Q14CM0 1322 aa21.79■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 Q6ZUG5 572 aa21.78■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.78■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PPTC7Q8NI37 304 aa21.78■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.78■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 MEIS2O14770 477 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 MMP3P08254 477 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 RPS6KB1P23443 525 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 SHHQ15465 462 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 USP17L6PQ6QN14 398 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 HIPK3Q9H422 1215 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 EHMT1Q9H9B1 1298 aa21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
MALSU1-201ENST00000287543 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 PPFIA4O75335 1185 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 RGS20O76081 388 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 ICAM3P32942 547 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 PCNX4Q63HM2 1172 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 IL31RAQ8NI17 732 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 BRF1Q92994 677 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 USP26Q9BXU7 913 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 FIBPO43427 364 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 B4GALT4O60513 344 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 NEDD9Q14511 834 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 NLRX1Q86UT6 975 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 LRCH3Q96II8 777 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 CDHR1Q96JP9 859 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.75■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 MCM3APO60318 1980 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 FUT2Q10981 343 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 RUFY3Q7L099 469 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 SESTD1Q86VW0 696 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA33Q96N06 139 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 LCTP09848 1927 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.74■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 GGPS1O95749 300 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 CPA1P15085 419 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 NAPAP54920 295 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 APOBRQ0VD83 1088 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 C9orf50Q5SZB4 431 aa21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
MALSU1-201ENST00000287543 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms