RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 ALCAMQ13740 583 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 KRT33BQ14525 404 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.84□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 ERICH4A6NGS2 130 aa14.83□□□□□ -0.03
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.83□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 SLFN12LQ6IEE8 588 aa14.83□□□□□ -0.03
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PDGFRB-201ENST00000261799 MAN1A1P33908 653 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 TRIM11Q96F44 468 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 SETDB1Q15047 1291 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa14.83□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.83□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF146Q9NTX7 359 aa14.82□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 AMFRQ9UKV5 643 aa14.82□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.82□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 TBCKQ8TEA7 893 aa14.81□□□□□ -0.04
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PDGFRB-201ENST00000261799 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 KCNJ18B7U540 433 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 TUBB2AQ13885 445 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 KCNJ12Q14500 433 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2SQ16763 222 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 C8orf74Q6P047 294 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 CROCCP2Q86T23 111 aa14.8□□□□□ -0.04
PDGFRB-201ENST00000261799 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
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