RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 HAS1Q92839 578 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP21Q9UK80 565 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TAF3Q5VWG9 929 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 EXOC4Q96A65 974 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.31■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GAKO14976 1311 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NCK2O43639 380 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SERPINB2P05120 415 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ATP2B4P23634 1241 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SCNN1DP51172 638 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 KIF11P52732 1056 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ZSCAN26Q16670 478 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TMC4Q7Z404 712 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ESYT2A0FGR8 921 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GABPAQ06546 454 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 CRY2Q49AN0 593 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 CERS5Q8N5B7 392 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.3■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 A0A1W2PQJ5 194 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L10C9JJH3 530 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GYS1P13807 737 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NT5C2P49902 561 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 KCNMA1Q12791 1236 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SPA17Q15506 151 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NFRKBQ6P4R8 1299 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 CREG2Q8IUH2 290 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 RAD21O60216 631 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SYF2O95926 243 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 PLCG2P16885 1265 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GPS2Q13227 327 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FIGNQ5HY92 759 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 BAP1Q92560 729 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.29■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FAM196BA6NMK8 535 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TUBB4BP68371 445 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SEMA3FQ13275 785 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 MAN2A1Q16706 1144 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 KRT79Q5XKE5 535 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SH2D4AQ9H788 454 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 STK17AQ9UEE5 414 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L15C9J2P7 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L11C9JVI0 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L18D6R9N7 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L22D6RA61 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L19D6RCP7 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L20D6RJB6 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 E9PMD0 336 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SMARCA1P28370 1054 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 EHHADHQ08426 723 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L24Q0WX57 530 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 COBLL1Q53SF7 1204 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 GBP3Q9H0R5 595 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 DEF6Q9H4E7 631 aa20.28■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 BUB1O43683 1085 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SNHG28P0DPA3 235 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SLC7A5Q01650 507 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ZNF543Q08ER8 600 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 SNX12Q9UMY4 172 aa20.27■□□□□ 0.84
PRDM12-201ENST00000253008 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 AKR1B10O60218 316 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 CAPN2P17655 700 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 CDK17Q00537 523 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 COASYQ13057 564 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.27■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 MYH10P35580 1976 aa20.26■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PRDM12-201ENST00000253008 RASSF7Q02833 373 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms