RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G6O60733 806 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGRTP55899 365 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKCZQ05513 592 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SYDE2Q5VT97 1194 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC174Q6PII3 467 aa29.68■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC3P19447 782 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CATIPQ7Z7H3 387 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 AGBL1Q96MI9 1066 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP8B1O43520 1251 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 STAT3P40763 770 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR142Q7Z601 462 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 VAT1LQ9HCJ6 419 aa29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 UBASH3AP57075 661 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GRM4Q14833 912 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 HOMER1Q86YM7 354 aa29.66■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED4O75132 1171 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRF4Q8IZF3 695 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 GJD2Q9UKL4 321 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PLXNB2O15031 1838 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 KLRF2D3W0D1 207 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 CUTAO60888 179 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SRRDQ9UH36 339 aa29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GYY5 206 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF28PB7ZC32 967 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 FLT3LGP49771 235 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 RESP18Q5W5W9 173 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 MICU3Q86XE3 530 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 VSTM4Q8IW00 320 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 TMTC2Q8N394 836 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A7Q9Y666 1083 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.64■■■□□ 2.34
CAPNS1-201ENST00000246533 BIN1O00499 593 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINC1P01008 464 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 APOA5Q6Q788 366 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 HOMER2Q9NSB8 354 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAI1Q9UI46 699 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CYTH3O43739 400 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNA1P78396 465 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN4Q92575 508 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ALG1Q9BT22 464 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX13BQ9BXU2 312 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 HSD3B7Q9H2F3 369 aa29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB8A8MWE9 144 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP6O43182 974 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK4P31152 587 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 JMJD4Q9H9V9 463 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF446Q9NWS9 450 aa29.62■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHA8P1O95397 391 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPAQ15257 358 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 COA7Q96BR5 231 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP2A1O14983 1001 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 DDAH1O94760 285 aa29.61■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.334e-11■□□□□ 10.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM29Q14134 588 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MNS1Q8NEH6 495 aa29.6■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PPFIA3O75145 1194 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC82Q8N4S0 544 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 DACH1Q9UI36 760 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 STK36Q9NRP7 1315 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPREP23469 700 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MORN1Q5T089 497 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT40Q6A162 431 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM65Q6PJ69 517 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCBQ8NB91 859 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K14Q99558 947 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 ALAS1P13196 640 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2B6P20813 491 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CLCN6P51797 869 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SHC4Q6S5L8 630 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO3Q6UWJ1 677 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 WASF1Q92558 559 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-201ENST00000246533 MUM1L1Q5H9M0 696 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-201ENST00000246533 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
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