RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CYTH3O43739 400 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 POLR2MP0CAP2 368 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 LIFRP42702 1097 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 NEK1Q96PY6 1258 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 IL23AQ9NPF7 189 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 PXMP2Q9NR77 195 aa25.17■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 OPLAHO14841 1288 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 MYL3P08590 195 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 ITGA7Q13683 1181 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 KRT32Q14532 448 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 TJAP1Q5JTD0 557 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SPZ1Q9BXG8 430 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 PRDM6Q9NQX0 595 aa25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 GRIN2DO15399 1336 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 HERVK_113Q902F9 699 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 HIPK3Q9H422 1215 aa25.15■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 NR3C2P08235 984 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 RXRAP19793 462 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 PSMC6P62333 389 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.14■■□□□ 1.62
NME4-201ENST00000219479 REV3LO60673 3130 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 SMARCA1P28370 1054 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 GHRHRQ02643 423 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MICU3Q86XE3 530 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 COPS5Q92905 334 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.13■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 KPNA6O60684 536 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 ARIH2O95376 493 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 PLEKHA8P1O95397 391 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 GH1P01241 217 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 FGD1P98174 961 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 RAB30Q15771 203 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 LY6KQ17RY6 165 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 PPM1EQ8WY54 764 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 PDCD2LQ9BRP1 358 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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NME4-201ENST00000219479 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MSRAQ9UJ68 235 aa25.12■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 B4GALT4O60513 344 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 FGBP02675 491 aa25.11■■□□□ 1.61
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NME4-201ENST00000219479 CCL23P55773 120 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 ADGRE1Q14246 886 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 SGMS1Q86VZ5 419 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 RASEFQ8IZ41 740 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 FANCBQ8NB91 859 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CUL5Q93034 780 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 WNT8AQ9H1J5 351 aa25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 NCOR1O75376 2440 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 A6NJR5 290 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 REC8O95072 547 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CCND2P30279 289 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 TSGA10IPQ3SY00 556 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CCDC62Q6P9F0 684 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 OTOP2Q7RTS6 562 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa25.1■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
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NME4-201ENST00000219479 TRANK1O15050 2925 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CHMP4BP1P59074 171 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 PGM5Q15124 567 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.09■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 APOA5Q6Q788 366 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 AFG1LQ8WV93 481 aa25.08■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
NME4-201ENST00000219479 MYH6P13533 1939 aa25.08■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 ZBTB43O43298 467 aa25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
NME4-201ENST00000219479 KCNV1Q6PIU1 500 aa25.07■■□□□ 1.6
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