RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173679.7

Eftud2-212, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Eftud2, Length 2,889 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Smtnl1Q99LM3 459 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 StrcQ8VIM6 1809 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Pcdha4O88689 947 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tubb2aQ7TMM9 445 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Map3k11Q80XI6 850 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Rab11fip4Q8BQP8 635 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Rcor2Q8C796 523 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Col23a1Q8K4G2 532 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Psmd2Q8VDM4 908 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Bhmt2Q91WS4 363 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tubb2bQ9CWF2 445 aa11.3□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Myh14Q6URW6 2000 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Mroh8E9PYI4 1049 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 EporP14753 507 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tcp11Q01755 566 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Znf827Q505G8 1078 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tmem232Q5K6N0 675 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ptger2Q62053 362 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Asic3Q6X1Y6 530 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Maip1Q8BHE8 291 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Spata32Q8C5V0 334 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Depdc1aQ8CIG0 804 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Sash3Q8K352 380 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ddah1Q9CWS0 285 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 RnmtQ9D0L8 465 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Prkab1Q9R078 270 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Apol6B7ZC55 329 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 OatP29758 439 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ifnar1P33896 590 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Akr1b1P45376 316 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Meis2P97367 477 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ccdc42Q5SV66 316 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 EregQ61521 162 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Herc4Q6PAV2 1057 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Csgalnact2Q8C1F4 542 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Bicdl2Q8CHW5 507 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Vav3Q9R0C8 847 aa11.29□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Gm5737A0A140LI11 423 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Magea10A2AMW4 325 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Nck2O55033 380 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Pls1Q3V0K9 630 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Meis1Q60954 390 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Sema4bQ62179 823 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Hoxa13Q62424 386 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 RragaQ80X95 313 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Morc2bQ8C5W4 1022 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Eif3cQ8R1B4 911 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tut1Q8R3F9 869 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Sec14l1A8Y5H7 715 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Apol10bG3X9K7 334 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Kif2aP28740 705 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Cdr2P97817 455 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Nsun7Q14AW5 724 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Krt14Q61781 484 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ankrd24Q80VM7 985 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Hirip3Q8BLH7 601 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Rassf4Q8CB96 322 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Slc4a8Q8JZR6 1089 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Kbtbd4Q8R179 534 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Rwdd2aQ9D9S3 292 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 CoasyQ9DBL7 563 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tex21Q9R0U9 575 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 ArcQ9WV31 396 aa11.28□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Esr2O08537 530 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Psmd14O35593 310 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Mpp3O88910 568 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Lrrc4bP0C192 709 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Nlrx1Q3TL44 975 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Map9Q3TRR0 646 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Mettl14Q3UIK4 456 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ddx3yQ62095 658 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Insm1Q63ZV0 521 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 WhrnQ80VW5 918 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Srgap2Q91Z67 1071 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Kif17Q99PW8 1038 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Josd2Q9CR30 188 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Psma7Q9Z2U0 248 aa11.27□□□□□ -0.6
Eftud2-212ENSMUST00000173679 PurbO35295 324 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Lig1P37913 916 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Tsr1Q5SWD9 803 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Shc3Q61120 474 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Haus4Q8BFT2 363 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Epc1Q8C9X6 813 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Trex1Q91XB0 314 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Card14Q99KF0 999 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Ccdc89Q9DA73 370 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 Klra17Q9JMA4 273 aa11.27□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 ErmardE9Q048 622 aa11.26□□□□□ -0.61
Eftud2-212ENSMUST00000173679 AoahO35298 574 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.7 ms