RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AampJ3QN89 436 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Stx8O88983 236 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hoxa11P31311 313 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Siah1bQ06985 282 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hhla1Q3TYV2 514 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ces3aQ63880 571 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ces3bQ8VCU1 571 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmco4Q91WU4 631 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GhdcQ99J23 532 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tas1r1Q99PG6 842 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cmtm5Q9D6G9 156 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubiad1Q9DC60 336 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Azi2Q9QYP6 405 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bcar3Q9QZK2 820 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wnt8bQ9WUD6 350 aa12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Umodl1Q5DID3 1319 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Diaph1O08808 1255 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mx1P09922 631 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bmpr1aP36895 532 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prdm6Q3UZD5 596 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 P3h1Q3V1T4 739 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Erc1Q99MI1 1120 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mad2l2Q9D752 211 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc15a2Q9ES07 729 aa12.76□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 C87977A2A958 498 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm13941A2AJ38 245 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gpr25P0C5I1 358 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hand2Q61039 217 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fut11Q8BHC9 489 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tceal5Q8CCT4 200 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Celf3Q8CIN6 465 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cluap1Q8R3P7 413 aa12.75□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam209A2APA5 170 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef26D3YYY8 869 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prr22F6TNE3 422 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Aff3P51827 1254 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Il1rapl1P59823 695 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcna2P63141 499 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fbln1Q08879 705 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znrf3Q5SSZ7 913 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kansl1Q80TG1 1036 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trim68Q8K243 485 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp2a1Q8R429 994 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Camkk1Q8VBY2 505 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgap8Q9CXP4 425 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wfdc1Q9ESH5 211 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Casp8ap2Q9WUF3 1962 aa12.74□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dock5B2RY04 1868 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Spink5Q148R4 1017 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dennd1bQ3U1T9 766 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam196aQ3USH1 422 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc27Q3V036 639 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ttc9Q3V038 219 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rgl1Q60695 768 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Q6P2K3 674 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 IqceQ6PCQ0 778 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Clca4aQ6Q473 924 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc2a12Q8BFW9 622 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rnf41Q8BH75 317 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bmp3Q8BHE5 468 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dmtf1Q8CE22 761 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Oit3Q8R4V5 546 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf521Q6KAS7 1311 aa12.73□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Smad4P97471 551 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Grin2cQ01098 1239 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ZbbxQ0P5X5 716 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gja6Q6S5G4 283 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Usp20Q8C6M1 916 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sept8Q8CHH9 429 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gprc5cQ8K3J9 440 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eml3Q8VC03 897 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr81Q5ND34 1934 aa12.72□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Oip5A2AQ14 241 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AU019823E9PUQ3 292 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hoxb3P09026 433 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hmox1P14901 289 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pik3r1P26450 724 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Resp18P47939 175 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atg4cQ811C2 458 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp4f39Q8BGU0 532 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tnnt3Q9QZ47 272 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sbf2E9PXF8 1872 aa12.71□□□□□ -0.37
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa12.71□□□□□ -0.38
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sptlc1O35704 473 aa12.71□□□□□ -0.38
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hoxc8P09025 242 aa12.71□□□□□ -0.38
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ChgaP26339 463 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kcnj6P48542 425 aa12.71□□□□□ -0.38
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Taf1bP97358 586 aa12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.4 ms