RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ifrd2	Q9D8U0	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Opn4	Q9QXZ9	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Phtf1	Q9QZ09	761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fbf1	A2A870	1173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm42421	F6X8D5	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm21319	F6YNI8	144 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Barx2	O08686	283 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Axin2	O88566	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Becn1	O88597	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt13	P08730	437 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Msx1	P13297	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tnfrsf9	P20334	256 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fosl1	P48755	273 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pld2	P97813	933 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc7a1	Q09143	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pgap2	Q3TQR0	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ceacam5	Q3UKK2	947 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spire1	Q52KF3	598 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ppp2r5c	Q60996	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr62	Q80UC6	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf38	Q8BI21	518 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Traf3ip3	Q8C0G2	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trhde	Q8K093	1025 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Matr3	Q8K310	846 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxc12	Q8K5B8	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cacnb4	Q8R0S4	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Polr3d	Q91WD1	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aco2	Q99KI0	780 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atg3	Q9CPX6	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elp3	Q9CZX0	547 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb43	Q9DAI4	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr12	Q9JJA4	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prodh	Q9WU79	599 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tagln2	Q9WVA4	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc41	Q692V3	1318 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	AI481877	A2ALV5	1481 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grin2a	P35436	1464 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb34	A2ATY4	518 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcsk6	F6XJP7	959 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pik3r2	O08908	722 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rag1	P15919	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rxrb	P28704	520 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hoxc11	P31313	304 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tst	P52196	297 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hsph1	Q61699	858 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cstb	Q62426	98 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nlrp4f	Q66X05	959 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tekt3	Q6X6Z7	490 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sez6	Q7TSK2	991 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rbbp8	Q80YR6	893 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Usp1	Q8BJQ2	784 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hexim1	Q8R409	356 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde6c	Q91ZQ1	861 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mlycd	Q99J39	492 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psip1	Q99JF8	528 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ndufaf7	Q9CWG8	436 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prkrip1	Q9CWV6	186 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dcdc2c	Q9D1B8	347 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep72	Q9D3R3	646 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rgs3	Q9DC04	966 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Treh	Q9JLT2	576 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Psma6	Q9QUM9	246 aa		4.59	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Soga1	E1U8D0	1418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scgb1b11	A0A087WQJ0	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fscb	A1EGX6	1074 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	9330159F19Rik	D3Z623	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wscd2	D4PHA7	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Capns1	O88456	269 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam167b	P17257	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wnt7b	P28047	349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casp2	P29594	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tbx1	P70323	479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casp4	P70343	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ciita	P79621	1155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kcnk6	Q3TBV4	313 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lins1	Q3U1D0	764 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Grxcr1	Q50H32	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep135	Q6P5D4	1140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dalrd3	Q6PJN8	538 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Teddm1a	Q810U2	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Aoc2	Q812C9	757 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atcay	Q8BHE3	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ston2	Q8BZ60	895 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Crispld2	Q8BZQ2	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vcpkmt	Q8C436	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kiaa0319l	Q8K135	1048 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ttc39c	Q8VE09	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccdc65	Q8VHI7	493 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Kctd10	Q922M3	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Desi1	Q9CQT7	168 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tdrd12	Q9CWU0	1215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Taf1d	Q9D4V4	322 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Suv39h2	Q9EQQ0	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Il21	Q9ES17	146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zc3h8	Q9JJ48	305 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dach1	Q9QYB2	751 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dnajb2	Q9QYI5	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Epm2a	Q9WUA5	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arid3b	Q9Z1N7	568 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rabl2	E9Q9D5	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16 ms