RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 Psen2Q61144 448 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 RragaQ80X95 313 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pank4Q80YV4 820 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 TbceQ8CIV8 524 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 NcapgE9PWG6 1004 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Orc4O88708 433 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Arl4aP61213 200 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 PhbP67778 272 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 RpgrQ9R0X5 1001 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vps8Q0P5W1 1427 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 RerglB2RVE2 204 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcnj2P35561 428 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpc4P51655 557 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 YwhagP61982 247 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Armcx2Q6A058 784 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tcaf3Q6QR59 914 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Q80ZQ3 298 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm5415E9PXF3 478 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd19P25918 547 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Papd5Q68ED3 633 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 MefvQ9JJ26 767 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rasa1E9PYG6 1038 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 PparaP23204 468 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Flt3Q00342 1000 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam196bQ6GQV1 535 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dcaf5Q80T85 946 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Disc1Q811T9 852 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa8.9□□□□□ -0.98
Cux1-201ENSMUST00000004097 Esr2O08537 530 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 AcadmP45952 421 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Eya1P97767 591 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 HscbQ8K3A0 234 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Eno3P21550 434 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ece1Q4PZA2 769 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ces3aQ63880 571 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ces3bQ8VCU1 571 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pcdha11Q91Y19 950 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Srgap2Q91Z67 1071 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 SncbQ91ZZ3 133 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam83bQ0VBM2 1012 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrfn2Q80TG9 788 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tom1l1Q923U0 474 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Krt71Q9R0H5 524 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dennd4bQ3U1Y4 1499 aa8.9□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm28961A0A087WPA5 222 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm21858A0A087WQ24 222 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pdzd8B9EJ80 1147 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Smcr8Q3UMB5 935 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Znf445Q8R2V3 986 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sept5Q9Z2Q6 369 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 AI481877A2ALV5 1481 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrrc6O88978 473 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sap130Q8BIH0 1057 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc151Q8BSN3 593 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr397Q8VEZ6 315 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Naip1Q9QWK5 1403 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sh3bp1P55194 680 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rnf112Q96DY5 654 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Serpina3mQ03734 418 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hvcn1Q3U2S8 269 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 IdeQ9JHR7 1019 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cul1Q9WTX6 776 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atg3Q9CPX6 314 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cap2Q9CYT6 476 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pdzd9Q9D9M4 266 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 NexmifQ5DTT1 1515 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Eya2O08575 532 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Trove2O08848 538 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 RarbP22605 482 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Trim7Q923T7 510 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zswim7Q9CWQ2 152 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 AceP09470 1312 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tcf3P15806 651 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Anks6Q6GQX6 883 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Armc9Q9D2I5 817 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Asah2Q9JHE3 756 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 4930430A15RikQ05AC5 485 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zbtb17Q60821 794 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam228aQ8CDW1 299 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Chordc1Q9D1P4 331 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rad51bO35719 350 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cyp2c37P56654 490 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 YwhahP68510 246 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rasgrf2P70392 1189 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Q8BZJ8 459 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 NelfbQ8C4Y3 580 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcnv2Q8CFS6 562 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cog3Q8CI04 820 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lzts2Q91YU6 671 aa8.89□□□□□ -0.99
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fbxo3Q9DC63 480 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19 ms