RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J UGP1P32861 499 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OAR1P35731 278 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J EAP1P36041 632 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC42P36094 363 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPP381P38282 291 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OM14P38325 134 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TDA11P38854 504 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GGC1P38988 300 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YER034WP40022 185 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J EMP65P40085 556 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MEP1P40260 492 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NEO1P40527 1151 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR115WP47152 169 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J STE24P47154 453 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BIO3P50277 480 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J EFM5P53200 248 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL092WP53934 400 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MSC1Q03104 513 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS60Q03390 229 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GAD1Q04792 585 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR109WQ06104 294 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC10Q06245 871 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP40Q08285 240 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RAX1Q08760 435 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AKR2Q12013 749 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RIO1Q12196 484 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL177CQ12257 170 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MHT1Q12525 324 aa2.5□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COX1P00401 534 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J DST1P07273 309 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH4P10127 382 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HOM3P10869 527 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KAR1P11927 433 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP2P20095 876 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR090CP25654 182 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J DPB3P27344 201 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PHA2P32452 334 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC5P32562 705 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SUI1P32911 108 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data2.49□□□□□ -2.01not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J RMA1P36001 430 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR078WP36158 585 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OMA1P36163 345 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ASC1P38011 319 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MOH1P38191 138 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BMT2P38278 337 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CHS7P38843 316 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC97P38863 823 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OAF1P39720 1047 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS26AP39938 119 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS26BP39939 119 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SAP1P39955 897 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TPA1P40032 644 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SER3P40054 469 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GID8P40208 455 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL152WP40455 235 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UTP25P40498 721 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC28P40509 296 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CUP9P41817 306 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SNO3P43544 222 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP32P43557 207 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J UBX6P47049 396 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J URB2P47108 1174 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HOC1P47124 396 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP31P49704 494 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AIF1P52923 378 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS73P53142 486 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NNF2P53253 936 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SHY1P53266 389 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL22BP56628 122 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OAZ1Q02803 292 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SRP1Q02821 542 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TAF11Q04226 346 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J APC4Q04601 652 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HDA3Q06623 655 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OMS1Q06668 471 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J CYK3Q07533 885 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FRA1Q07825 749 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J XYL2Q07993 356 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J REX4Q08237 289 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VHS3Q08438 674 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR053CQ12026 108 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RUD3Q12234 484 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RUP1Q12242 671 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MMP1Q12372 583 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR064WQ12492 139 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J KCS1Q12494 1050 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RMP1Q12530 201 aa2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NOP14Q99207 810 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ARG4P04076 463 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HXK2P04807 486 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COS2P0CX12 379 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COS3P0CX13 379 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data2.48□□□□□ -2.01not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS33P20795 691 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J BAS1P22035 811 aa2.48□□□□□ -2.01
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