RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CIN4	P39110	191 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	POP1	P41812	875 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	THP1	Q08231	455 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YCR007C	P25354	239 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CBP4	P37267	147 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CHK1	P38147	527 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SLZ1	P40167	298 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PAN6	P40459	309 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	BSC5	P53755	489 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RAD30	Q04049	632 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YPS3	Q12303	508 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	GSC2	P40989	1895 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
HAL9	YOL089C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	FAR3	P46671	204 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YNR061C	P53747	219 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PSK1	P31374	1356 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	STB6	P36085	766 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	BNA4	P38169	460 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	FUI1	P38196	639 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	AXL2	P38928	823 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PRM5	P40476	318 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YGR021W	P53212	290 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	MDG1	P53885	366 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YDR239C	Q03780	787 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	VID22	Q05934	901 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PRM7	Q12459	698 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SSH4	P32343	579 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	IES6	P32617	166 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	UTR4	P32626	227 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	TIM17	P39515	158 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	BNA5	Q05979	453 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YPQ1	Q12010	308 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	NTE1	Q04958	1679 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	NAM2	P11325	894 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RIB5	P38145	238 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	FAU1	P40099	211 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	REE1	P40893	198 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	IBD2	P53892	351 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CHS3	P29465	1165 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	KKQ8	P36004	724 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	LIP2	Q06005	328 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	IES4	Q08561	116 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CHD1	P32657	1468 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YCR100C	P25606	316 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	DPB3	P27344	201 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	XRS2	P33301	854 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	CST26	P38226	397 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ALG5	P40350	334 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RMD8	P43620	662 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	HER2	Q03557	464 aa		0.87	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	FAB1	P34756	2278 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SUC2	P00724	532 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	SHP1	P34223	423 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	LAM5	P43560	674 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	VID30	P53076	958 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RSN1	Q03516	953 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	NPL6	P32832	435 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YBR144C	P34215	104 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	DRE2	P36152	348 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	DUG2	P38149	878 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ADA2	Q02336	434 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	INA17	Q02888	182 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	YML131W	Q03102	365 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		0.86	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	MRP20	P32387	263 aa		0.85	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	RRN3	P36070	627 aa		0.85	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
HAL9	YOL089C	NUP133	P36161	1157 aa		0.85	□□□□□ -2.27

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