RNA–Protein interactions for RNA: YMR308C

PSE1, Transcript of Karyopherin/importin that interacts with the nuclear pore complex, yeast

Gene PSE1, Length 3,270 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSE1	YMR308C	WSS1	P38838	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CSM2	P40465	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YGL138C	P53122	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YGR122W	P53272	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RSM27	P53305	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MAL12	P53341	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SOV1	Q04748	898 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YLR297W	Q05899	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YPR127W	Q06494	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SFM1	Q12314	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SSK2	P53599	1579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SPS4	P09937	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TRK1	P12685	1235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GAL3	P13045	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GSY1	P23337	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PMT2	P31382	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SEF1	P34228	1148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MCD4	P36051	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YHR045W	P38775	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CHS6	P40955	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PAC11	P40960	533 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	UFD1	P53044	361 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PSE1	YMR308C	OST6	Q03723	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	THI22	Q06490	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SAM3	Q08986	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SUL2	Q12325	893 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ATG31	Q12421	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PRC1	P00729	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	URA6	P15700	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	HCM1	P25364	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PHA2	P32452	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MKS1	P34072	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RCK2	P38623	610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SPC97	P38863	823 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	AKR1	P39010	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	TNA1	P53322	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YMR027W	Q04371	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ROY1	Q04847	553 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PNP1	Q05788	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GSH2	Q08220	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CTI6	Q08923	506 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	BAG7	Q12128	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ATG34	Q12292	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	VCX1	Q99385	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	REV3	P14284	1504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CDC8	P00572	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ATP6	P00854	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	NGG1	P32494	702 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PTC7	P38797	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	FAD1	P38913	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	DIA3	P52290	468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ALT2	P52892	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	IMO32	P53219	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PEX15	Q08215	383 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YRR1	Q12172	810 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	GPM3	Q12326	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	DGK1	Q12382	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MTF2	P10849	440 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RAD18	P10862	487 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	HOG1	P32485	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ECM25	P32525	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CSG2	P35206	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CSE4	P36012	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YKL070W	P36087	169 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YBR184W	P38299	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YBR259W	P38338	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SHR5	P41912	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	PFD1	P46988	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	YGL159W	P53110	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	RAD1	P06777	1100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SGF29	P25554	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	DUG2	P38149	878 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	FET3	P38993	636 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ACO2	P39533	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	ECM10	P39987	644 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	SER3	P40054	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PSE1	YMR308C	FAU1	P40099	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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