RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	MCX1	P38323	520 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	OM14	P38325	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ICE2	P40499	491 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MDM34	P53083	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BCH1	Q05029	724 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RSC2	Q06488	889 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	AI1	P03875	834 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RAD1	P06777	1100 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	CKI1	P20485	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MGR1	P25573	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	HXT4	P32467	576 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	VHC1	P38329	1120 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	EFM1	P38732	585 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MUP3	P38734	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YDR089W	P38966	869 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	TAT2	P38967	592 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	HXT7	P39004	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	AZF1	P41696	914 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BUD32	P53323	261 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	DMA2	P53924	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	CTR9	P89105	1077 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BSC2	Q05611	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MDM32	Q12171	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RSR1	P13856	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SSH4	P32343	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	CDC5	P32562	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ALG3	P38179	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	POP4	P38336	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	FRT2	P39734	528 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	EMP65	P40085	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	APQ12	P40532	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SPT20	P50875	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MAL11	P53048	616 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BOL2	P53082	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ROG1	P53118	685 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SLT2	Q00772	484 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ATG21	Q02887	496 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GOT1	Q03554	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SPO20	Q04359	397 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	FRA1	Q07825	749 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	AIM41	Q12032	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PUS9	Q12069	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	REX3	Q12090	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GCR1	P07261	785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MGT1	P26188	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	DCG1	P32460	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
ATG33	YLR356W	YBR071W	P38243	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SEC9	P40357	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SAE2	P46946	345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	NMD5	P46970	1048 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	TEL2	P53038	688 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	MET32	Q12041	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	RGT2	Q12300	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	AAD3	P25612	363 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SDH3	P33421	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	LHS1	P36016	881 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YBR062C	P38239	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	VPS52	P39904	641 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	NEO1	P40527	1151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YJL043W	P47053	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	CLD1	P53264	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	ALG12	P53730	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	BOP3	P53958	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	SDH1	Q00711	640 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG33	YLR356W	YSA1	Q01976	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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