RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE4	YKL049C	MRE11	P32829	692 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	AVT5	P38176	459 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	PCA1	P38360	1216 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MBB1	P39534	108 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	ERP2	P39704	215 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	IDP2	P41939	412 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	BOR1	P53838	576 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	TIM10	P87108	93 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YDR239C	Q03780	787 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	MFB1	Q04922	465 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	TLG2	Q08144	397 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	RSA1	Q08932	381 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSE4	YKL049C	YBR139W	P38109	508 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CST26	P38226	397 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YEL057C	P39983	233 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	POP1	P41812	875 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	WSC2	P53832	503 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	PDS5	Q04264	1277 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RRI2	Q12348	645 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RKM5	Q12367	367 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SEC39	Q12745	709 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CTF3	Q12748	733 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	ATP11	P32453	318 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YOX1	P34161	385 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	FAU1	P40099	211 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SPO22	P40511	975 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	TWF1	P53250	332 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SLG1	P54867	378 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MED1	Q12321	566 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	TOP1	P04786	769 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	BUB3	P26449	341 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RSM22	P36056	628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SYG1	P40528	902 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	URB2	P47108	1174 aa		2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YML133C	Q03099	1374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YLL067C	Q07888	1374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YLL066C	Q99208	1374 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	ARG3	P05150	338 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	PMR1	P13586	950 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	FRE2	P36033	711 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CBP4	P37267	147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	VID24	P38263	362 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SDS24	P38314	527 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	2.74	□□□□□ -1.97	not detected
CSE4	YKL049C	YPI1	P43587	155 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YGL108C	P53139	140 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	PIR3	Q03180	325 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	HNT3	Q08702	217 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	ATG29	Q12092	213 aa		2.74	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MRP7	P12687	371 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	NDI1	P32340	513 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SEC66	P33754	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CMC1	P36064	111 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MET18	P40469	1032 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SPG5	P42933	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	AVT4	P50944	713 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CAF40	P53829	373 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	SOV1	Q04748	898 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.73	□□□□□ -1.97	not detected
CSE4	YKL049C	RIM20	Q12033	661 aa		2.73	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	HIP1	P06775	603 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	GPI10	P30777	616 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	MRP4	P32902	394 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	PMT1	P33775	817 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	GCD10	P41814	478 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	HXT14	P42833	540 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	ARK1	P53974	638 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.72	□□□□□ -1.97
CSE4	YKL049C	RHO2	P06781	192 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	RAD14	P28519	371 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	AFG1	P32317	509 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	YFL067W	P43537	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	YGL242C	P53066	181 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	POP6	P53218	158 aa		2.71	□□□□□ -1.98
CSE4	YKL049C	JJJ1	P53863	590 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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