RNA–Protein interactions for RNA: YHR148W

IMP3, Transcript of Component of the SSU processome, yeast

Gene IMP3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMP3	YHR148W	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.23	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	NDC1	P32500	655 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	HXT14	P42833	540 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	YGL260W	P53056	76 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	RRD2	Q12461	358 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.22	□□□□□ -1.73
IMP3	YHR148W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RPR2	P40571	144 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RTT101	P47050	842 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SRB7	P47822	140 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	GPI1	P53306	609 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	KTR5	P53966	522 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	CRZ1	P53968	678 aa		4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SPC110	P32380	944 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	PTR2	P32901	601 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SYG1	P40528	902 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YGL108C	P53139	140 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SAS3	P34218	831 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	JNM1	P36224	373 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RPH1	P39956	796 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	HAT2	P39984	401 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	IRC15	Q02733	499 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	AYT1	Q12226	474 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SCM3	Q12334	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.18	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	HEM2	P05373	342 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	NPL6	P32832	435 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	KRE9	P39005	276 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	POP1	P41812	875 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YGR149W	P48236	432 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YDL186W	P48568	277 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	COS10	P52924	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
IMP3	YHR148W	SET6	Q12529	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	PHO2	P07269	559 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	PPH22	P23595	377 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	BUB3	P26449	341 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RAD14	P28519	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	THI2	P38141	450 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	MDM31	P38880	579 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	SHO1	P40073	367 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	GWT1	P47026	490 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	VPS74	Q06385	345 aa		4.16	□□□□□ -1.74
IMP3	YHR148W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ATP10	P18496	279 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	EXO70	P19658	623 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YIM1	P28625	365 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	AFG1	P32317	509 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	AGA1	P32323	725 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	PMU1	P36069	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	FAU1	P40099	211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	ARK1	P53974	638 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RTT103	Q05543	409 aa		4.15	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RHO2	P06781	192 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	NFU1	P32860	256 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	YJL213W	P40896	331 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	PPT2	Q12036	173 aa		4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	FRE2	P36033	711 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	TUL1	P36096	758 aa		4.13	□□□□□ -1.75
IMP3	YHR148W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75

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