RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W

DSE2, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeast

Gene DSE2, Length 978 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE2	YHR143W	CMC1	P36064	111 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	MDM31	P38880	579 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	IPI3	P53877	555 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	TOF2	Q02208	771 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	BNA5	Q05979	453 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YDL057W	Q07379	328 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	PPT2	Q12036	173 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	RLM1	Q12224	676 aa		3.11	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SUC2	P00724	532 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	CLC1	P17891	233 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	REC107	P21651	314 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YCR007C	P25354	239 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SAS3	P34218	831 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SHP1	P34223	423 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	MSR1	P38714	643 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	HXT14	P42833	540 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	RTT101	P47050	842 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	VPS9	P54787	451 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	COQ9	Q05779	260 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SYO1	Q07395	620 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	ISA2	Q12425	185 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.1	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	ELO2	P25358	347 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	BUD14	P27637	709 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	NDC1	P32500	655 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	UTR4	P32626	227 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	PTR2	P32901	601 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	STB6	P36085	766 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	APE4	P38821	490 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	VPS52	P39904	641 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SSU1	P41930	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	not detected
DSE2	YHR143W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	CIK1	Q01649	594 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	SLD5	Q03406	294 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	THP1	Q08231	455 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
DSE2	YHR143W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	OPI1	P21957	404 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	CLB1	P24868	471 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YCR051W	P25631	222 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	SPC110	P32380	944 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	PMT1	P33775	817 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	DUG2	P38149	878 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	AIM22	P47051	409 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YDL186W	P48568	277 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	COS10	P52924	374 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	ERO1	Q03103	563 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	IVY1	Q04934	453 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	VTA1	Q06263	330 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.08	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	CYB2	P00175	591 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	EXO70	P19658	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YME1	P32795	747 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	MSN2	P33748	704 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	BNA4	P38169	460 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	RPH1	P39956	796 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	JEM1	P40358	645 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	RPR2	P40571	144 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	VPS74	Q06385	345 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	SET6	Q12529	373 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	ISN1	Q99312	450 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.07	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	ATR1	P13090	542 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.06	□□□□□ -1.92	not detected
DSE2	YHR143W	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	FRE1	P32791	686 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YJL213W	P40896	331 aa		3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
DSE2	YHR143W	GPI1	P53306	609 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.2 ms