RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	YHR214W	P0CX19	203 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	CSM1	P25651	190 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	PHO91	P27514	894 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	KAE1	P36132	386 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SLM4	P38247	162 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	IST2	P38250	946 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ECM10	P39987	644 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SER33	P40510	469 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GCD10	P41814	478 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MEP2	P41948	499 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MPS3	P47069	682 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	COG7	P53195	279 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GPI1	P53306	609 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YHM2	Q04013	314 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	PPN1	Q04119	674 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GGA1	Q06336	557 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	RAD34	Q06665	692 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	OCA4	P25366	362 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ATP11	P32453	318 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	COX13	P32799	129 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ROT2	P38138	954 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	DBP8	P38719	431 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	RPH1	P39956	796 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	IMA5	P40884	581 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YGL176C	P46945	554 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SWC4	P53201	476 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YNL033W	P53964	284 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YNL019C	P53975	284 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.98	□□□□□ -1.45	RIP-Chip
YCK1	YHR135C	AAT1	Q01802	451 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	BSC2	Q05611	235 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YLR413W	Q06689	675 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YDL121C	Q07541	149 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	UAF30	Q08747	228 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MUM3	Q08750	479 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	TGL5	Q12043	749 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MSF1	P08425	469 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	UGA1	P17649	471 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ATP7	P30902	174 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FUN30	P31380	1131 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YME2	P32843	850 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	not detected
YCK1	YHR135C	MAC1	P35192	417 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MRP8	P35719	219 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FRE2	P36033	711 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MRPL17	P36528	281 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	HSE1	P38753	452 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	CYC2	P38909	366 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FAD1	P38913	306 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	BEM4	P39011	633 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	EMP65	P40085	556 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	NAS6	P50086	228 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MRK1	P50873	501 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FLC3	P53121	802 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ECM9	Q02202	377 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YDR124W	Q04608	324 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GMC2	Q06201	188 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	NKP1	Q12493	238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SEC39	Q12745	709 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MSS18	P08593	268 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	URA4	P20051	364 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	EPT1	P22140	391 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	SOL2	P37262	315 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	FMP32	P43557	207 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GTO1	P48239	356 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	DIA3	P52290	468 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	NPY1	P53164	384 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	MET31	Q03081	177 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YMR010W	Q03687	405 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	RAD33	Q04231	177 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	BCH1	Q05029	724 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	ULA1	Q12059	462 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	TAF3	Q12297	353 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	YOR012W	Q12351	137 aa		5.96	□□□□□ -1.45
YCK1	YHR135C	GTT2	Q12390	233 aa		5.96	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.4 ms