RNA–Protein interactions for RNA: YHR120W

MSH1, Transcript of DNA-binding protein of the mitochondria, yeast

Gene MSH1, Length 2,880 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSH1	YHR120W	GAT1	P43574	510 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NNF1	P47149	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YKR005C	Q02203	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YEH2	Q07950	538 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ABF1	P14164	731 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	RNQ1	P25367	405 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CWP1	P28319	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SHU2	P38957	223 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CEM1	P39525	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BNI4	P53858	892 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ROT1	Q03691	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SMP3	Q04174	516 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	TRM12	Q04235	462 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GMC2	Q06201	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GAL4	P04386	881 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SNF4	P12904	322 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ATP11	P32453	318 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	IST2	P38250	946 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YBR285W	P38354	144 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UME6	P39001	836 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	AIM20	P40451	204 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NAS6	P50086	228 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEC10	Q06245	871 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GRS2	Q06817	618 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	UGA1	P17649	471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEC15	P22224	910 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CLB2	P24869	491 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SEC66	P33754	206 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SKG1	P36169	355 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ARA1	P38115	344 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	LEU5	P38702	357 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
MSH1	YHR120W	ECM10	P39987	644 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	BOL2	P53082	120 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	HST3	P53687	447 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	ESA1	Q08649	445 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	MUM3	Q08750	479 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MSH1	YHR120W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	NMT1	P14743	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	FES1	P38260	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	MUP3	P38734	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YEN1	P40028	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	COA1	P40452	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	IMA5	P40884	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	PFA3	P42836	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	AIF1	P52923	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	RMR1	P53060	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	CRN1	Q06440	651 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	UBX3	Q12229	455 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	PSY3	Q12318	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	TPK2	P06245	380 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	COR1	P07256	457 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	EFM1	P38732	585 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	STB1	P42845	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	MRK1	P50873	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	SHE4	P51534	789 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	AAT1	Q01802	451 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	MMT1	Q03218	510 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	GAS3	Q03655	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YVC1	Q12324	675 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	STT4	P37297	1900 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	PHO81	P17442	1178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	TEC1	P18412	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	DMC1	P25453	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	YHR045W	P38775	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	TIS11	P47977	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSH1	YHR120W	GPI1	P53306	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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