RNA–Protein interactions for RNA: YBR279W

PAF1, Transcript of Component of the Paf1p complex involved in transcription elongation, yeast

Gene PAF1, Length 1,338 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAF1	YBR279W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SYO1	Q07395	620 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GRX6	Q12438	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	CYB2	P00175	591 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RHO2	P06781	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	CLC1	P17891	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	CLB3	P24870	427 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RAD14	P28519	371 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	NPL6	P32832	435 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	REC114	P32841	428 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MSN2	P33748	704 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	VTA1	Q06263	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	PHO92	Q06390	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RTN2	Q12443	393 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	NDC1	P32500	655 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MDM31	P38880	579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	YMR087W	Q04299	284 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	BNA5	Q05979	453 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	AFG1	P32317	509 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	FRE1	P32791	686 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	GYP6	P32806	458 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RSM22	P36056	628 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	VPS52	P39904	641 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RTT101	P47050	842 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAF1	YBR279W	SPS4	P09937	338 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	REC107	P21651	314 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	YGL108C	P53139	140 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	PPT2	Q12036	173 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	ERG3	P32353	365 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	YBP1	P38315	674 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	YGR149W	P48236	432 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SLG1	P54867	378 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SOV1	Q04748	898 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SET6	Q12529	373 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	MRS3	P10566	314 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SPC110	P32380	944 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	NFU1	P32860	256 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	HCS1	P34243	683 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SHO1	P40073	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	VTC2	P43585	828 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	ALG8	P40351	577 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	ATR1	P13090	542 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	BUD14	P27637	709 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	RPH1	P39956	796 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	FAU1	P40099	211 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	FMS1	P50264	508 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	TAP42	Q04372	366 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	ATP11	P32453	318 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	BYE1	P36106	594 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	SYG1	P40528	902 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAF1	YBR279W	BUB3	P26449	341 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YJL213W	P40896	331 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	SSU1	P41930	458 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	GWT1	P47026	490 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	DSL1	P53847	754 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	HSP42	Q12329	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	PHO2	P07269	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	ATP10	P18496	279 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	SAS3	P34218	831 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAF1	YBR279W	FRE2	P36033	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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