RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641558.1

MFSD8-238, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 526 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-238	ENST00000641558	KCNAB2	Q13303	367 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NSMF	Q6X4W1	530 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KCNN1	Q92952	543 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	DNAJC7	Q99615	494 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SLC38A3	Q99624	504 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		5	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558		F8W031	263 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	HRK	O00198	91 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TSPAN15	O95858	294 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NTRK1	P04629	796 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CYBB	P04839	570 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CDR1	P51861	262 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PRR5	P85299	388 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	USP33	Q8TEY7	942 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	LNPK	Q9C0E8	428 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	C22orf46	C9J442	243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SEMA7A	O75326	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	GLDC	P23378	1020 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NR1I3	Q14994	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	IQCE	Q6IPM2	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CEP68	Q76N32	757 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558		Q8N1Y9	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	UBXN4	Q92575	508 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	MKL1	Q969V6	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NFIB	O00712	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ABLIM1	O14639	778 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	FBLN1	P23142	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SSPN	Q14714	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CABP7	Q86V35	215 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	LDHD	Q86WU2	507 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	NETO2	Q8NC67	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PIF1	Q9H611	641 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MFSD8-238	ENST00000641558	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	LSAMP	Q13449	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	PKN1	Q16512	942 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	PANK1	Q8TE04	598 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	TMEM169	Q96HH4	297 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	CDC6	Q99741	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	GPR27	Q9NS67	375 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	CLDND1	Q9NY35	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558		X6R8D5	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MFSD8-238	ENST00000641558	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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