RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 NXPE1Q8N323 547 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SPATA5Q8NB90 893 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CCT6BQ92526 530 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TBATAQ96M53 351 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CORO1BQ9BR76 489 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RNF38Q9H0F5 515 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CABP5Q9NP86 173 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 WHRNQ9P202 907 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 APEX2Q9UBZ4 518 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PGAP2Q9UHJ9 254 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 EMC9Q9Y3B6 208 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.06□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DCDC2BA2VCK2 349 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 BLACEA4D250 179 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 H3BRJ5 948 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 FZD9O00144 591 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 XPOTO43592 962 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 AP1G1O43747 822 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 OFD1O75665 1012 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CPP00450 1065 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SLFN14P0C7P3 912 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SRGNP10124 158 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ELNP15502 786 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RHCEP18577 417 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CD247P20963 164 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 GTF2A2P52657 109 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RHDQ02161 417 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DSG1Q02413 1049 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 MYBPC2Q14324 1141 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ODF1Q14990 250 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 POU4F3Q15319 338 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 LONRF1Q17RB8 773 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SLC6A19Q695T7 634 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CYB5RLQ6IPT4 315 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 MZT2AQ6P582 158 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PPFIBP1Q86W92 1011 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 C12orf40Q86WS4 652 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 DCAF4Q8WV16 495 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 POF1BQ8WVV4 589 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CCDC138Q96M89 665 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SLC30A3Q99726 388 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 LGR4Q9BXB1 951 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 WNT10AQ9GZT5 417 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 LACRTQ9GZZ8 138 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 VTA1Q9NP79 307 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 EMC7Q9NPA0 242 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PICK1Q9NRD5 415 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PHF24Q9UPV7 400 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 PTPN22Q9Y2R2 807 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.05□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 C9IYK1 514 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ANP32CO43423 234 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 TBX1O43435 398 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CBFA2T2O43439 604 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 KCNH1O95259 989 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ZBED1O96006 694 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 BMP4P12644 408 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ITGA4P13612 1032 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 HSD3B1P14060 373 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 KCNA6P17658 529 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 USP14P54578 494 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 GFRA1P56159 465 aa3.04□□□□□ -1.92
ATRX-220ENST00000635865 CTBSQ01459 385 aa3.04□□□□□ -1.92
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