RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 PNMA5Q96PV4 448 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 TRIM9Q9C026 710 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GDAQ9Y2T3 454 aa15.49■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 PRELPP51888 382 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 CCZ1BP86790 482 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 NELFBQ8WX92 580 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 INTS13Q9NVM9 706 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 PIK3CDO00329 1044 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 OPLAHO14841 1288 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 PRCPP42785 496 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 ARMCX5Q6P1M9 558 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SV2BQ7L1I2 683 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 KIFC2Q96AC6 838 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 KCNMB3Q9NPA1 279 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 FEM1BQ9UK73 627 aa15.48■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SREBF1P36956 1147 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 FEZ1Q99689 392 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 HACL1Q9UJ83 578 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 STIM1Q13586 685 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 ADSSL1Q8N142 457 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GINM1Q9NU53 330 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 ASIC1P78348 528 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC174Q6PII3 467 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 EXOC1Q9NV70 894 aa15.47■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1B0GTH6 734 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 Q4G0T1 1027 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 GJA10Q969M2 543 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.46■□□□□ 0.07
FCHO1-221ENST00000597512 NRDCO43847 1150 aa15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 NR1I3Q14994 352 aa15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 RAD54LQ92698 747 aa15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.46■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 TBX3O15119 743 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 PDE4DQ08499 809 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 MCM6Q14566 821 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF541Q9H0D2 1346 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 DOCK1Q14185 1865 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 PSMA7O14818 248 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 SLC26A4O43511 780 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 COBLO75128 1261 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 PRR16Q569H4 304 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CIITAP33076 1130 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 SPAG1Q07617 926 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 HYIQ5T013 277 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 ETNPPLQ8TBG4 499 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 ABCB11O95342 1321 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 H7C1D1 291 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CYP3A4P08684 503 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 PPP1R2P41236 205 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 LPAR1Q92633 364 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 MYMKA6NI61 221 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 CFBP00751 764 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 POLR2MP0CAP2 368 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 PTPN21Q16825 1174 aa15.44■□□□□ 0.06
FCHO1-221ENST00000597512 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.7 ms