RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
BRD4-208	ENST00000597315	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
BRD4-208	ENST00000597315		Q9Y3F1	56 aa		31.14	■■■□□ 2.58
BRD4-208	ENST00000597315	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
BRD4-208	ENST00000597315	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	MYADML2	A6NDP7	307 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	PPP2R5B	Q15173	497 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	SCFD2	Q8WU76	684 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	COL20A1	Q9P218	1284 aa		31.13	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	ASGR1	P07306	291 aa		31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	RTN1	Q16799	776 aa		31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CUL5	Q93034	780 aa		31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CPA1	P15085	419 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	BEX3	Q00994	111 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	TTLL4	Q14679	1199 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315		Q6ZUG5	572 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	PXMP2	Q9NR77	195 aa		31.11	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	OPLAH	O14841	1288 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	31.1	■■■□□ 2.57	6e-8	■□□□□ 11
BRD4-208	ENST00000597315	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	GHRHR	Q02643	423 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM60	Q495X7	471 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	USP26	Q9BXU7	913 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		31.1	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	RPS6KB1	P23443	525 aa		31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	SNX17	Q15036	470 aa		31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	ELP1	O95163	1332 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	NR3C2	P08235	984 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	RCAN1	P53805	252 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	NKX3-2	P78367	333 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	BRF1	Q92994	677 aa		31.08	■■■□□ 2.57
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		31.07	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CABYR	O75952	493 aa		31.07	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	31.07	■■■□□ 2.56	3e-6	■■□□□ 14.5
BRD4-208	ENST00000597315	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CPT1A	P50416	773 aa		31.06	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	APOBR	Q0VD83	1088 aa		31.06	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	TLE2	Q04725	743 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		31.05	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CTAGE5	O15320	804 aa		31.04	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CCND2	P30279	289 aa		31.04	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		31.04	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	RUFY3	Q7L099	469 aa		31.04	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		31.04	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	PTGS1	P23219	599 aa		31.03	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	PGM5	Q15124	567 aa		31.03	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		31.03	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		31.03	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		31.01	■■■□□ 2.56
BRD4-208	ENST00000597315	GH1	P01241	217 aa		31.01	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	MYL3	P08590	195 aa		31.01	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	CLTB	P09497	229 aa		31.01	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	FBXL16	Q8N461	479 aa		31.01	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		31.01	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	ARVCF	O00192	962 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	COPS5	Q92905	334 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	TOX2	Q96NM4	488 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	GDF15	Q99988	308 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	31	■■■□□ 2.55
BRD4-208	ENST00000597315		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	31	■■■□□ 2.55

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